RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.52■■□□□ 1.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 PTPRFP10586 1907 aa23.52■■□□□ 1.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 PFASO15067 1338 aa23.52■■□□□ 1.36
CD27-AS1-208ENST00000538616 TBC1D12O60347 775 aa23.51■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 AACSQ86V21 672 aa23.51■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAI14Q9P0K7 980 aa23.51■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 GAKO14976 1311 aa23.51■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 DOCK2Q92608 1830 aa23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL6A1P12109 1028 aa23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIB2Q92519 343 aa23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 GUCD1Q96NT3 240 aa23.5■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 BTDP43251 543 aa23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPP2Q13103 211 aa23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.49■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 DOCK1Q14185 1865 aa23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZAP70P43403 619 aa23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 VCANP13611 3396 aa23.48■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.47■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.47■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.47■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRDM6Q9NQX0 595 aa23.47■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.47■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 CYP2B6P20813 491 aa23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 HMGCS2P54868 508 aa23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 PICALMQ13492 652 aa23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.45■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRC26Q2I0M4 334 aa23.45■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.45■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.45■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 RAB11FIP3O75154 756 aa23.44■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 GSTO1P78417 241 aa23.44■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM161BQ96MY7 647 aa23.44■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.44■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L5A8MUK1 530 aa23.43■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 LDHCP07864 332 aa23.43■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 RHBDL3P58872 404 aa23.43■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.43■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLURP2P0DP57 97 aa23.42■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAPK4P31152 587 aa23.42■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 LHX8Q68G74 356 aa23.42■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.42■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 CAP2P40123 477 aa23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 CRBNQ96SW2 442 aa23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa23.41■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.4■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.4■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
CD27-AS1-208ENST00000538616 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 RGS2P41220 211 aa23.39■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.39■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP6NLQ92738 828 aa23.38■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.38■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 FAM196BA6NMK8 535 aa23.37■■□□□ 1.33
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