RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534967.1

GOLGA3-204, Transcript of golgin A3, human

TSL 3

Gene GOLGA3, Length 484 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GOLGA3-204	ENST00000534967	FLT1	P17948	1338 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	GDF11	O95390	407 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRIM27	P14373	513 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	SYN1	P17600	705 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		32.38	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	PLCG2	P16885	1265 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	PPP4C	P60510	307 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	PALD1	Q9ULE6	856 aa		32.37	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	C19orf81	C9J6K1	198 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		32.36	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	USP17L10	C9JJH3	530 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		32.35	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	DLL1	O00548	723 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	TNNI3K	Q59H18	835 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	CLUAP1	Q96AJ1	413 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		32.34	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	PDE3A	Q14432	1141 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967		Q3C1V9	767 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		32.33	■■■□□ 2.77
GOLGA3-204	ENST00000534967	PFAS	O15067	1338 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	MAPK4	P31152	587 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	ERVK-9	P63128	1117 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	ERVK-24	P63145	666 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	PORCN	Q9H237	461 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	GPR108	Q9NPR9	543 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	GINM1	Q9NU53	330 aa		32.32	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		32.31	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	BCAR3	O75815	825 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	GPR142	Q7Z601	462 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	USP6NL	Q92738	828 aa		32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	HLA-DOA	P06340	250 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZAP70	P43403	619 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCL14	Q16627	93 aa		32.29	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	32.29	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	CCND3	P30281	292 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	RGS2	P41220	211 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	POLA2	Q14181	598 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	MORN1	Q5T089	497 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		32.28	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	GPR153	Q6NV75	609 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967		Q7L0L9	218 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	TDH	Q8IZJ6	230 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	DEFB123	Q8N688	67 aa		32.27	■■■□□ 2.76
GOLGA3-204	ENST00000534967	GH2	P01242	217 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	COL6A1	P12109	1028 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	LHX8	Q68G74	356 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		32.26	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	CYP7A1	P22680	504 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	APBA2	Q99767	749 aa		32.25	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	SSH3	Q8TE77	659 aa		32.24	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	FEZ1	Q99689	392 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	32.23	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967		A0A0C4DFX4	3053 aa		32.23	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	CNMD	O75829	334 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	ATP8B2	P98198	1209 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		32.22	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	IGSF3	O75054	1194 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	C12orf42	Q96LP6	360 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		32.21	■■■□□ 2.75
GOLGA3-204	ENST00000534967	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		32.21	■■■□□ 2.75

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