RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534323.1

BBOX1-208, Transcript of gamma-butyrobetaine hydroxylase 1, human

TSL 2

Gene BBOX1, Length 457 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBOX1-208	ENST00000534323	CHRNA5	P30532	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	IL13	P35225	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	CLDN10	P78369	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	PLAUR	Q03405	335 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	PANK3	Q9H999	370 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	RAX	Q9Y2V3	346 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		4.9	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	C21orf2	O43822	256 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	TOMM70	O94826	608 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	MED26	O95402	600 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	IGLV1-40	P01703	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	RARA	P10276	462 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	GLB1	P16278	677 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	CABP4	P57796	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	GPLD1	P80108	840 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	RTN1	Q16799	776 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	WWC1	Q8IX03	1113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	CCDC87	Q9NVE4	849 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	STOML1	Q9UBI4	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	COL15A1	P39059	1388 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SCN11A	Q9UI33	1791 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	USP17L3	A6NCW0	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	USP17L4	A6NCW7	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	NFKBIE	O00221	500 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	TM4SF1	P30408	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	RFC4	P35249	363 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	GRIK1	P39086	918 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	MTHFS	P49914	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	NFIX	Q14938	502 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	JMY	Q8N9B5	988 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SLC52A2	Q9HAB3	445 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	RNF181	Q9P0P0	153 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	IDH3A	P50213	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	TRIM26	Q12899	539 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SIX5	Q8N196	739 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	TIMELESS	Q9UNS1	1208 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	CLSPN	Q9HAW4	1339 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	SASH3	O75995	380 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	HMOX1	P09601	288 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	INPP5B	P32019	993 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	NRL	P54845	237 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	FSTL1	Q12841	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	MTHFSD	Q2M296	383 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323		Q6ZS46	218 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BBOX1-208	ENST00000534323	MORC1	Q86VD1	984 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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