RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533252.1

CASP4-211, Transcript of caspase 4, humanhuman

TSL 3

Gene CASP4, Length 215 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4-211ENST00000533252 COL8A1P27658 744 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.17□□□□□ -1.26
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CASP4-211ENST00000533252 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 PTPRMP28827 1452 aa7.17□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
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CASP4-211ENST00000533252 ZNF165P49910 485 aa7.16□□□□□ -1.26
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CASP4-211ENST00000533252 DYMQ7RTS9 669 aa7.16□□□□□ -1.26
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CASP4-211ENST00000533252 IGF2-ASQ6U949 168 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 DPH6Q7L8W6 267 aa7.15□□□□□ -1.26
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CASP4-211ENST00000533252 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 SPATA32Q96LK8 384 aa7.15□□□□□ -1.26
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CASP4-211ENST00000533252 DISC1Q9NRI5 854 aa7.15□□□□□ -1.26
CASP4-211ENST00000533252 USP21Q9UK80 565 aa7.15□□□□□ -1.26
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CASP4-211ENST00000533252 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa7.15□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.14□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.14□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 ADH5P11766 374 aa7.13□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 TTLL4Q14679 1199 aa7.13□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 SCARA3Q6AZY7 606 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 CRBNQ96SW2 442 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.13□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.13□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 NEFMP07197 916 aa7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 FBRSQ9HAH7 460 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.12□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 ST7Q9NRC1 585 aa7.12□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.11□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 YEATS2Q9ULM3 1422 aa7.11□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 MEGF11A6BM72 1044 aa7.11□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 GIPRP48546 466 aa7.11□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 PPP2R5EQ16537 467 aa7.11□□□□□ -1.27
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CASP4-211ENST00000533252 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CASP4-211ENST00000533252 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.11□□□□□ -1.27
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