RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521962.1

HACE1-211, Transcript of HECT domain and ankyrin repeat containing E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 4

Gene HACE1, Length 561 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1-211ENST00000521962 USP17L21D6R901 530 aa19.8■□□□□ 0.76
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HACE1-211ENST00000521962 SHMT1P34896 483 aa19.8■□□□□ 0.76
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HACE1-211ENST00000521962 ALX1Q15699 326 aa19.7■□□□□ 0.74
HACE1-211ENST00000521962 BMP2KLQ5H9B9 411 aa19.7■□□□□ 0.74
HACE1-211ENST00000521962 GPAT2Q6NUI2 795 aa19.7■□□□□ 0.74
HACE1-211ENST00000521962 STK11IPQ8N1F8 1099 aa19.7■□□□□ 0.74
HACE1-211ENST00000521962 ZNF280CQ8ND82 737 aa19.7■□□□□ 0.74
HACE1-211ENST00000521962 WDR18Q9BV38 432 aa19.7■□□□□ 0.74
HACE1-211ENST00000521962 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
HACE1-211ENST00000521962 RASA1P20936 1047 aa19.69■□□□□ 0.74
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