RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515647.1

MRPS30-204, Transcript of mitochondrial ribosomal protein S30, human

TSL 3

Gene MRPS30, Length 733 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPS30-204	ENST00000515647	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	NBPF4	Q96M43	638 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	C2orf49	Q9BVC5	232 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	RASA1	P20936	1047 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	CST9	Q5W186	159 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	UCN2	Q96RP3	112 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	ZFAT	Q9P243	1243 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	TM4SF1	P30408	202 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	HOXC9	P31274	260 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	PLEKHM2	Q8IWE5	1019 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	WWC1	Q8IX03	1113 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	10.17	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	TARS	P26639	723 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	ATG3	Q9NT62	314 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	KLK14	Q9P0G3	267 aa		10.16	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	SMG6	Q86US8	1419 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647		A0A0C4DFX4	3053 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	LTBP3	Q9NS15	1303 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647		M0R2N6	131 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	SAPCD2	Q86UD0	394 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		10.15	□□□□□ -0.78
MRPS30-204	ENST00000515647	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		10.15	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	TRAF5	O00463	557 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	ATP9B	O43861	1147 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SASH3	O75995	380 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	DKK1	O94907	266 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	HIF1A	Q16665	826 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SIX5	Q8N196	739 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	HINFP	Q9BQA5	517 aa		10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	FST	P19883	344 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	IDH3A	P50213	366 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	IGF2-AS	Q6U949	168 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	EFCC1	Q9HA90	598 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	USP20	Q9Y2K6	914 aa		10.13	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SZT2	Q5T011	3432 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	TRPA1	O75762	1119 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SERPINB2	P05120	415 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	RARA	P10276	462 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	FBLN1	P23142	703 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	NOG	Q13253	232 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	RTN1	Q16799	776 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	IFT43	Q96FT9	208 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		10.12	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	FLII	Q13045	1269 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	NFIX	Q14938	502 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	AKTIP	Q9H8T0	292 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.11	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	IER5	Q5VY09	327 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SPG7	Q9UQ90	795 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	KDR	P35968	1356 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SBNO2	Q9Y2G9	1366 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	MON2	Q7Z3U7	1717 aa		10.1	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	RAD21	O60216	631 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	EPB42	P16452	691 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	INPP5B	P32019	993 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	PCSK7	Q16549	785 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	SOGA3	Q5TF21	947 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	HDGFL2	Q7Z4V5	671 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	RNF186	Q9NXI6	227 aa		10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
MRPS30-204	ENST00000515647	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8

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