RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 SSH3Q8TE77 659 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 NBPF3Q9H094 633 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.12■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 SYN1P17600 705 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 PPP4CP60510 307 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 ATP8B2P98198 1209 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.11■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 A0A0C4DFX4 3053 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 PFASO15067 1338 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 PLCG2P16885 1265 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 WDR18Q9BV38 432 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 DNAJC18Q9H819 358 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 MYH1P12882 1939 aa22.1■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 MTMR2Q13614 643 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 GPR153Q6NV75 609 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 Q7L0L9 218 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.09■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 FLT1P17948 1338 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 CYP2B6P20813 491 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 BACE1P56817 501 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 LRIT3Q3SXY7 679 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
ITGA3-215ENST00000515147 ASNSP08243 561 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 ZAP70P43403 619 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 DEFB123Q8N688 67 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 USP6NLQ92738 828 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 PALD1Q9ULE6 856 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 CUL9Q8IWT3 2517 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 HERVK_113P62684 666 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 Q3C1V9 767 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 IGSF3O75054 1194 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 COL6A1P12109 1028 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 TDHQ8IZJ6 230 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 GDF11O95390 407 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 CCL14Q16627 93 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 PORCNQ9H237 461 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 C19orf81C9J6K1 198 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 USP17L10C9JJH3 530 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 RLBP1P12271 317 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 MORN1Q5T089 497 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 LHX8Q68G74 356 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 GINM1Q9NU53 330 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 MTMR10Q9NXD2 777 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 CYP7A1P22680 504 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGA3-215ENST00000515147 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 HLA-DOAP06340 250 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 MAPK4P31152 587 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 ERVK-9P63128 1117 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 ERVK-24P63145 666 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 GPR142Q7Z601 462 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 DNAH12Q6ZR08 3092 aa22■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 MIGA1Q8NAN2 632 aa22■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22■■□□□ 1.11
ITGA3-215ENST00000515147 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms