RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 LAPTM4AQ15012 233 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SASS6Q6UVJ0 657 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GMLQ99445 158 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 MEIS3Q99687 375 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 CHMP4AQ9BY43 222 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TSPY26PQ9H489 355 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GABRQQ9UN88 632 aa8.58□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 FAM205AQ6ZU69 1335 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 RAB11FIP3O75154 756 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 CHMLP26374 656 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GRAPQ13588 217 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PKP1Q13835 747 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SHHQ15465 462 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 MAP3K11Q16584 847 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 C9orf50Q5SZB4 431 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 NUDT18Q6ZVK8 323 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SLF2Q8IX21 1173 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PRIMPOLQ96LW4 560 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 CACNA1FO60840 1977 aa8.57□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TPM3P06753 285 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 MX1P20591 662 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 HOXD10P28358 340 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 HSPA4P34932 840 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GGCXP38435 758 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 NEK4P51957 841 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 Q6ZNB5 142 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 COL26A1Q96A83 441 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PHOX2BQ99453 314 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PRR14Q9BWN1 585 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB3Q9H5J0 574 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 IL21Q9HBE4 155 aa8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM22K7EJ46 135 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ADCY3O60266 1144 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 USP2O75604 605 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TEFQ10587 303 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TBC1D16Q8TBP0 767 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 DEFB129Q9H1M3 183 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PODXL2Q9NZ53 605 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 BDP1A6H8Y1 2624 aa8.55□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 NCOR1O75376 2440 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SYCE3A1L190 88 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 GPR37L1O60883 481 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 BMP1P13497 986 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 FOXK2Q01167 660 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 DCTN1Q14203 1278 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC183Q5T5S1 534 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC30Q5VVM6 783 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 C17orf99Q6UX52 265 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 IL17REQ8NFR9 667 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SSH3Q8TE77 659 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 KCNB2Q92953 911 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 EYA3Q99504 573 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 STK31Q9BXU1 1019 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ZMYND15Q9H091 742 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SPTLC3Q9NUV7 552 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PFASO15067 1338 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 RAD50Q92878 1312 aa8.54□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 BTBD19C9JJ37 291 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 HOXB7P09629 217 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 KCNQ1P51787 676 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 UBE2HP62256 183 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TFF2Q03403 129 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 LRRC26Q2I0M4 334 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 ZNF34Q8IZ26 560 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 FBXL18Q96ME1 805 aa8.53□□□□□ -1.04
SMIM20-202ENST00000514384 TTC14Q96N46 770 aa8.53□□□□□ -1.04
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