RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514178.5

PGGT1B-205, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 4

Gene PGGT1B, Length 553 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-205ENST00000514178 RAG1P15918 1043 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 ANAPC15P60006 121 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC10A6Q3KNW5 377 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM13CQ8NE31 585 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 PICK1Q9NRD5 415 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TJP2Q9UDY2 1190 aa11.01□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TMPRSS2O15393 492 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC7A5Q01650 507 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TMX1Q9H3N1 280 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa11□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 FANCGO15287 622 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 RAB11FIP3O75154 756 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 AMPD1P23109 780 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 NTF4P34130 210 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TCEA2Q15560 299 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 GNPTABQ3T906 1256 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SLFN12Q8IYM2 578 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM87BQ96K49 555 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SPATA9Q9BWV2 254 aa10.99□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 ASMTLO95671 621 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM153BP0C7A2 387 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 YARSP54577 528 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 AKAP4Q5JQC9 854 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 EPN3Q9H201 632 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 CRIM1Q9NZV1 1036 aa10.98□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TERTO14746 1132 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 ADCY3O60266 1144 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 BCRP11274 1271 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 HID1Q8IV36 788 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 FBRSQ9HAH7 460 aa10.97□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 CCNFP41002 786 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 DUOXA2Q1HG44 320 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM67Q5HYA8 995 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 PHACTR4Q8IZ21 702 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SYNPOQ8N3V7 929 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 ZNF507Q8TCN5 953 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC16A10Q8TF71 515 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 DISC1Q9NRI5 854 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 CD2APQ9Y5K6 639 aa10.96□□□□□ -0.65
PGGT1B-205ENST00000514178 WISP1O95388 367 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 SLURP2P0DP57 97 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 MASP1P48740 699 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A19Q695T7 634 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 RNF214Q8ND24 703 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC6A18Q96N87 628 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 KIF2CQ99661 725 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 RUSC1Q9BVN2 902 aa10.95□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 RGS13O14921 159 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 DGKGP49619 791 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 PMS1P54277 932 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 NKG7Q16617 165 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 LONRF2Q1L5Z9 754 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 BBS9Q3SYG4 887 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 PPFIBP1Q86W92 1011 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 TMEM192Q8IY95 271 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 IRF7Q92985 503 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 DHRS1Q96LJ7 313 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 AP4E1Q9UPM8 1137 aa10.94□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 DLL1O00548 723 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 UBOX5O94941 541 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 NEFMP07197 916 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 AMPD3Q01432 767 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 UBE3DQ7Z6J8 389 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 FBXO11Q86XK2 927 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 SLC26A8Q96RN1 970 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 ATXN3LQ9H3M9 355 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 FAM86C1Q9NVL1 165 aa10.93□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 MEGF11A6BM72 1044 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 ADH5P11766 374 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 TTLL4Q14679 1199 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 PLAAQ9Y263 795 aa10.92□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 NUTM2GQ5VZR2 741 aa10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PGGT1B-205ENST00000514178 SGSM3Q96HU1 749 aa10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.7 ms