RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 HSF2BPO75031 334 aa13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 PEX19P40855 299 aa13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 IFT88Q13099 833 aa13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 L1RE1Q9UN81 338 aa13.5□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 MINDY4BA8MYZ0 360 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 MYO1BO43795 1136 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC172P0C7W6 258 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ATP5JP18859 108 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 HOXC9P31274 260 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CYP27A1Q02318 531 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 RPAINQ86UA6 219 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SH2D3CQ8N5H7 860 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 POLR3EQ9NVU0 708 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SAR1BQ9Y6B6 198 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 USP31Q70CQ4 1352 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ROBO2Q9HCK4 1378 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 GOLGA6L10A6NI86 522 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 FGAP02671 866 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 GRIN1Q05586 938 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF174Q15697 407 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 USP49Q70CQ1 688 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CNGA4Q8IV77 575 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 MED4Q9NPJ6 270 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 FAM53CQ9NYF3 392 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa13.49□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF185O15231 689 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 NR5A1Q13285 461 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 TAX1BP1Q86VP1 789 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 DENND2AQ9ULE3 1009 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SUFUQ9UMX1 484 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 PPARAQ07869 468 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SPA17Q15506 151 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 TANGO6Q9C0B7 1094 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CRB1P82279 1406 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 MLKLQ8NB16 471 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CD248Q9HCU0 757 aa13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 TBC1D31Q96DN5 1066 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 WWC3Q9ULE0 1092 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 FLT4P35916 1363 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 PAFAH1B1P43034 410 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 FCHSD1Q86WN1 690 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 JAKMIP2Q96AA8 810 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CHP1Q99653 195 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SBNO1A3KN83 1393 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 EXOC5O00471 708 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 GCKRQ14397 625 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 OSBP2Q969R2 916 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC113Q9H0I3 377 aa13.47□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 E7EVH7 732 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 MCM3P25205 808 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ARID5AQ03989 594 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 TRIM47Q96LD4 638 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 MMS19Q96T76 1030 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 SMIM23A6NLE4 172 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 M0R2C6 588 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 CLGNO14967 610 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 AKR1B10O60218 316 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 LRRC24Q50LG9 513 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 ESCO1Q5FWF5 840 aa13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
PRRX1-207ENST00000497230 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 CFAP58Q5T655 872 aa13.46□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.46□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 EPSTI1Q96J88 318 aa13.46□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 SELENOOQ9BVL4 669 aa13.46□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 NAPBQ9H115 298 aa13.46□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 MAST3O60307 1309 aa13.45□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.45□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 CNNM1Q9NRU3 951 aa13.45□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 INTS13Q9NVM9 706 aa13.45□□□□□ -0.26
PRRX1-207ENST00000497230 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.7 ms