RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489650.1

PTPRN-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-217ENST00000489650 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.65■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 FLT1P17948 1338 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 MAST2Q6P0Q8 1798 aa22.64■■□□□ 1.22
PTPRN-217ENST00000489650 ASNSP08243 561 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 POLA2Q14181 598 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 TRIB2Q92519 343 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 FOCADQ5VW36 1801 aa22.64■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 PLCG2P16885 1265 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 ZAP70P43403 619 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 LRCH3Q96II8 777 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 GPR108Q9NPR9 543 aa22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L10C9JJH3 530 aa22.62■■□□□ 1.21
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PTPRN-217ENST00000489650 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 HERVK_113P62684 666 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 ATP8B2P98198 1209 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 Q3C1V9 767 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 ANKLE1Q8NAG6 615 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.62■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 LAMA3Q16787 3333 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 C19orf81C9J6K1 198 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 CCER2I3L3R5 266 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 SSH3Q8TE77 659 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.61■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 NBPF3Q9H094 633 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 A0A1W2PPC1 479 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 SYN1P17600 705 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 CYP7A1P22680 504 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 PORCNQ9H237 461 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 MYH1P12882 1939 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 COL6A3P12111 3177 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 HLA-DOAP06340 250 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 GDF15Q99988 308 aa22.58■■□□□ 1.21
PTPRN-217ENST00000489650 GH2P01242 217 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 ERVK-9P63128 1117 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 ERVK-24P63145 666 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 CCL14Q16627 93 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 MAPK4P31152 587 aa22.56■■□□□ 1.2
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PTPRN-217ENST00000489650 PDE3AQ14432 1141 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 GPR142Q7Z601 462 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 GINM1Q9NU53 330 aa22.56■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 USP5P45974 858 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 USP6NLQ92738 828 aa22.55■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 BMP8BP34820 402 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 MORN1Q5T089 497 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 SLC17A8Q8NDX2 589 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 PFASO15067 1338 aa22.54■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 RGS2P41220 211 aa22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 CNMDO75829 334 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 FEZ1Q99689 392 aa22.52■■□□□ 1.2
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L15C9J2P7 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L11C9JVI0 530 aa22.51■■□□□ 1.19
PTPRN-217ENST00000489650 USP17L18D6R9N7 530 aa22.51■■□□□ 1.19
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