RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 UBP1Q9NZI7 540 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 PIM2Q9P1W9 311 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 FAM170BA6NMN3 283 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 HTR3BO95264 441 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 ZNF165P49910 485 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 SEZ6Q53EL9 994 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 SLC6A19Q695T7 634 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 TMEM87BQ96K49 555 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 SPATA32Q96LK8 384 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 GRIN3BO60391 1043 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-204ENST00000487939 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 TGFB1P01137 390 aa7.29□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTEN-204ENST00000487939 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
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PTEN-204ENST00000487939 KLHL3Q9UH77 587 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.26□□□□□ -1.25
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PTEN-204ENST00000487939 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
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PTEN-204ENST00000487939 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTEN-204ENST00000487939 PCMTD2Q9NV79 361 aa7.23□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.23□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.22□□□□□ -1.25
PTEN-204ENST00000487939 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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