RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484375.5

ARPC1B-218, Transcript of actin related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

TSL 3

Gene ARPC1B, Length 785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1B-218ENST00000484375 CCDC17Q96LX7 622 aa26.87■■□□□ 1.89
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ARPC1B-218ENST00000484375 SLURP2P0DP57 97 aa26.86■■□□□ 1.89
ARPC1B-218ENST00000484375 PTPRAP18433 802 aa26.86■■□□□ 1.89
ARPC1B-218ENST00000484375 CDK8P49336 464 aa26.86■■□□□ 1.89
ARPC1B-218ENST00000484375 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa26.86■■□□□ 1.89
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ARPC1B-218ENST00000484375 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa26.85■■□□□ 1.89
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ARPC1B-218ENST00000484375 IL25Q9H293 177 aa26.84■■□□□ 1.89
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ARPC1B-218ENST00000484375 SNAPC2Q13487 334 aa26.82■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 TMEM179Q6ZVK1 233 aa26.82■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 SLC44A5Q8NCS7 719 aa26.82■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 ZHX2Q9Y6X8 837 aa26.82■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 GH2P01242 217 aa26.81■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 KCNH4Q9UQ05 1017 aa26.81■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 GJA5P36382 358 aa26.8■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 ZNF280CQ8ND82 737 aa26.79■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 WDR18Q9BV38 432 aa26.79■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.79■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa26.79■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 MAP4K1Q92918 833 aa26.78■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 SMIM22K7EJ46 135 aa26.77■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 RASA1P20936 1047 aa26.77■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 TM4SF4P48230 202 aa26.77■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 CTDSPL2Q05D32 466 aa26.77■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.77■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 STK11IPQ8N1F8 1099 aa26.77■■□□□ 1.88
ARPC1B-218ENST00000484375 STAG1Q8WVM7 1258 aa26.77■■□□□ 1.88
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ARPC1B-218ENST00000484375 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.76■■□□□ 1.87
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ARPC1B-218ENST00000484375 FGRP09769 529 aa26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 AKR1B1P15121 316 aa26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 HAND2P61296 217 aa26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 PTH1RQ03431 593 aa26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 SH2D4AQ9H788 454 aa26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.76■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 REC8O95072 547 aa26.75■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 ALDH1A1P00352 501 aa26.75■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 MS4A4AQ96JQ5 239 aa26.75■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 KANSL2Q9H9L4 492 aa26.75■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.75■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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ARPC1B-218ENST00000484375 C19orf81C9J6K1 198 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 USP17L10C9JJH3 530 aa26.74■■□□□ 1.87
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ARPC1B-218ENST00000484375 TSPY3P0CV98 308 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 TSPY8P0CW00 308 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 JAG1P78504 1218 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 SPP2Q13103 211 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 SEPT2Q15019 361 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 CCL15Q16663 113 aa26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
ARPC1B-218ENST00000484375 CNNM2Q9H8M5 875 aa26.74■■□□□ 1.87
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