RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	BCS1L	Q9Y276	419 aa		11.18	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	SRGN	P10124	158 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	USP5	P45974	858 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	LBX1	P52954	281 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	TXNRD3	Q86VQ6	643 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MYH1	P12882	1939 aa		11.17	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	GAK	O14976	1311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MYH8	P13535	1937 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	USP17L12	C9JPN9	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	USP17L21	D6R901	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	KIF5B	P33176	963 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MYSM1	Q5VVJ2	828 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	STYK1	Q6J9G0	422 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	FANCB	Q8NB91	859 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	TNMD	Q9H2S6	317 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		11.16	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MMP10	P09238	476 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62	3e-8	■■■■□ 20.2
UFD1-208	ENST00000484101	CDC27	P30260	824 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	GNAQ	P50148	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	STK38	Q15208	465 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	KRT40	Q6A162	431 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	ADAL	Q6DHV7	355 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	DGKH	Q86XP1	1220 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MPND	Q8N594	471 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	USP28	Q96RU2	1077 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	RBSN	Q9H1K0	784 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
UFD1-208	ENST00000484101	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	C6orf229	H3BNL8	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	KIN	O60870	393 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PPP6R2	O75170	966 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	BMP15	O95972	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	MMP1	P03956	469 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ME1	P48163	572 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SF3A1	Q15459	793 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	LINC00301	Q8NCQ3	95 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PANK2	Q9BZ23	570 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	POLL	Q9UGP5	575 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CEP131	Q9UPN4	1083 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.14	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	SPTLC2	O15270	562 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	ANO1	Q5XXA6	986 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CNKSR1	Q969H4	720 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PGBD1	Q96JS3	809 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	CREBZF	Q9NS37	354 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	DACT1	Q9NYF0	836 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PSME4	Q14997	1843 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		11.13	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101		H0YIN7	160 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	LIG1	P18858	919 aa		11.12	□□□□□ -0.63
UFD1-208	ENST00000484101	BTD	P43251	543 aa		11.12	□□□□□ -0.63

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