RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476342.1

HOXB3-208, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,420 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-208ENST00000476342 PPARAQ07869 468 aa35.22■■■■□ 3.23
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HOXB3-208ENST00000476342 GDF11O95390 407 aa35.21■■■■□ 3.23
HOXB3-208ENST00000476342 CDK8P49336 464 aa35.21■■■■□ 3.23
HOXB3-208ENST00000476342 PPIL2Q13356 520 aa35.21■■■■□ 3.23
HOXB3-208ENST00000476342 SLC44A5Q8NCS7 719 aa35.21■■■■□ 3.23
HOXB3-208ENST00000476342 ZNF287Q9HBT7 754 aa35.21■■■■□ 3.23
HOXB3-208ENST00000476342 SMIM22K7EJ46 135 aa35.2■■■■□ 3.23
HOXB3-208ENST00000476342 GJA5P36382 358 aa35.2■■■■□ 3.23
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HOXB3-208ENST00000476342 TMEM179Q6ZVK1 233 aa35.11■■■■□ 3.21
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HOXB3-208ENST00000476342 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
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HOXB3-208ENST00000476342 TSPY3P0CV98 308 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-208ENST00000476342 TSPY8P0CW00 308 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-208ENST00000476342 ICA1Q05084 483 aa35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-208ENST00000476342 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
HOXB3-208ENST00000476342 TBC1D10CQ8IV04 446 aa35.02■■■■□ 3.2
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