RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 FAM200AQ8TCP9 573 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 USP25Q9UHP3 1055 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 SNED1Q8TER0 1413 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 STK36Q9NRP7 1315 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 FOSBP53539 338 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 RTN1Q16799 776 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.12■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 IFNAR1P17181 557 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 IARSP41252 1262 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 FOCADQ5VW36 1801 aa22.11■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TPM3P06753 285 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TPM2P07951 284 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TYRO3Q06418 890 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 FANCBQ8NB91 859 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 FLT1P17948 1338 aa22.1■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TSPY2A6NKD2 308 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CTAGE5O15320 804 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CALM1P0DP23 149 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CALM2P0DP24 149 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CALM3P0DP25 149 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 GUCY1B3Q02153 619 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 HHIPL2Q6UWX4 724 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 TTLL6Q8N841 843 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ALG1Q9BT22 464 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 MRVI1Q9Y6F6 885 aa22.09■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 ECE2O60344 883 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 BICD2Q8TD16 824 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 PHKBQ93100 1093 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.08■■□□□ 1.13
SYF2-204ENST00000476231 F8W031 263 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TPRNQ4KMQ1 711 aa22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 WASF1Q92558 559 aa22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 DDAH1O94760 285 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 MXD3Q9BW11 206 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 MRIQ9BWK5 157 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 MYH1P12882 1939 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 PLCD1P51178 756 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TEKT1Q969V4 418 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 C21orf2O43822 256 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 NR1I2O75469 434 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TFAP4Q01664 338 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 DACT2Q5SW24 774 aa22.06■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 USP17L3A6NCW0 530 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 USP17L4A6NCW7 530 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 AOC3Q16853 763 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 CCDC93Q567U6 631 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 BRAPQ7Z569 592 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.05■■□□□ 1.12
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SYF2-204ENST00000476231 TROAPQ12815 778 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 SASS6Q6UVJ0 657 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 NBPF11Q86T75 865 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 DGKHQ86XP1 1220 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.05■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 KCNA3P22001 575 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 SCNN1DP51172 638 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TRIM29Q14134 588 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 CAMK4Q16566 473 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 ANKS1AQ92625 1134 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 SCN9AQ15858 1988 aa22.04■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 NMT2O60551 498 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 DEXIO95424 95 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 DPEP1P16444 411 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 AIFM3Q96NN9 605 aa22.03■■□□□ 1.12
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