RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ABCC6	O95255	1503 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	OPA1	O60313	960 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	UPP2	O95045	317 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	KIF4A	O95239	1232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SCTR	P47872	440 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP1A2	P50993	1020 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NDUFA8	P51970	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	GUCY1A3	Q02108	690 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NECTIN1	Q15223	517 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PPP1R15B	Q5SWA1	713 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NLRP14	Q86W24	1093 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PDILT	Q8N807	584 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TSC22D3	Q99576	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PIDD1	Q9HB75	910 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	L3MBTL1	Q9Y468	752 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		4.96	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MCM3	P25205	808 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC121	Q6ZUS5	278 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	BICD1	Q96G01	975 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ADGRB1	O14514	1584 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PPP1R37	O75864	691 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM107A	O95990	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MYBL1	P10243	752 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PRKAR2B	P31323	418 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MYBPC3	Q14896	1274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MMS19	Q96T76	1030 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ZFAT	Q9P243	1243 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147		M0R2C6	588 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PDLIM1	O00151	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ATP6V1G1	O75348	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	POLD1	P28340	1107 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ME1	P48163	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MYL5	Q02045	173 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	STK3	Q13188	491 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	LRRC23	Q53EV4	343 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SPECC1	Q5M775	1068 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SPECC1L	Q69YQ0	1117 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CHADL	Q6NUI6	762 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CNKSR1	Q969H4	720 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM184B	Q9ULE4	1060 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	KIAA0556	O60303	1618 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	PNPLA6	Q8IY17	1366 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RBMS1-208	ENST00000474147	SMIM24	O75264	130 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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