RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 MAP7Q14244 749 aa7.46□□□□□ -1.22
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PRPF40A-208ENST00000472760 RGS13O14921 159 aa7.39□□□□□ -1.23
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PRPF40A-208ENST00000472760 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 MIPEPQ99797 713 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 RAXQ9Y2V3 346 aa7.39□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 CCNFP41002 786 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 GSK3AP49840 483 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 CDK5R2Q13319 367 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 FXNQ16595 210 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 CCDC144BQ3MJ40 725 aa7.38□□□□□ -1.23
PRPF40A-208ENST00000472760 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.38□□□□□ -1.23
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