RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470953.1

VARS-222, Transcript of valyl-tRNA synthetase, human

TSL 3

Gene VARS, Length 392 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VARS-222	ENST00000470953	KCNA5	P22460	613 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	IRS1	P35568	1242 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	KCNJ4	P48050	445 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TNNI2	P48788	182 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZP2	Q05996	745 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZNF365	Q70YC5	407 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CEP250	Q9BV73	2442 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	SPEG	Q15772	3267 aa		7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	COL4A4	P53420	1690 aa	Predicted RBP	7.51	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	SOBP	A7XYQ1	873 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CXCL11	O14625	94 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PEX10	O60683	326 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PKN1	Q16512	942 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	HERC4	Q5GLZ8	1057 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	FRMD5	Q7Z6J6	570 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	FBXL6	Q8N531	539 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	EDA	Q92838	391 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ANKRD2	Q9GZV1	360 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	HYPK	Q9NX55	129 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PTPRF	P10586	1907 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZNF521	Q96K83	1311 aa		7.5	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	KBTBD13	C9JR72	458 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CHL1	O00533	1208 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	KDM4A	O75164	1064 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	IGKV5-2	P06315	115 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ITGA6	P23229	1130 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CNGA1	P29973	690 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TREML2	Q5T2D2	321 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	KIAA2013	Q8IYS2	634 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZNF536	O15090	1300 aa		7.49	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	MYH3	P11055	1940 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TIMP1	P01033	207 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	SLC5A1	P13866	664 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CSF2RA	P15509	400 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	AVPR2	P30518	371 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	GOLGA2	Q08379	1002 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	FAAP100	Q0VG06	881 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	GRB10	Q13322	594 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ANO1	Q5XXA6	986 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	DCAF15	Q66K64	600 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	MFSD5	Q6N075	450 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	FAM83A	Q86UY5	434 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CCDC146	Q8IYE0	955 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ARNTL2	Q8WYA1	636 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	USP6NL	Q92738	828 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		7.48	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ANP32C	O43423	234 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	MSC	O60682	206 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	LPXN	O60711	386 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ARHGEF15	O94989	841 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CA3	P07451	260 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	PTPRA	P18433	802 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	GYG1	P46976	350 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	RIPK4	P57078	832 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	NEUROD2	Q15784	382 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	CCDC174	Q6PII3	467 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		7.47	□□□□□ -1.21
VARS-222	ENST00000470953	TRPV1	Q8NER1	839 aa		7.47	□□□□□ -1.21

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