RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.83	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	KIAA0355	O15063	1070 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	HERVK_113	P62684	666 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		13.82	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ERC2	O15083	957 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	TLL1	O43897	1013 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ERVK-9	P63128	1117 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ERVK-24	P63145	666 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CD320	Q9NPF0	282 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		13.81	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ENTPD3	O75355	529 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CYBA	P13498	195 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	FBXL18	Q96ME1	805 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	UIMC1	Q96RL1	719 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.8	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	PRDX5	P30044	214 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	IDI2	Q9BXS1	227 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	YBX2	Q9Y2T7	364 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.79	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	MTMR2	Q13614	643 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	RASIP1	Q5U651	963 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	PHOX2B	Q99453	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.78	□□□□□ -0.2
HCLS1-204	ENST00000468693	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	PICALM	Q13492	652 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	LRRC41	Q15345	812 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	TMEM240	Q5SV17	173 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	WDR78	Q5VTH9	848 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	BBX	Q8WY36	941 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	HERVK_113	Q902F9	699 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	RUNDC1	Q96C34	613 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	MSRA	Q9UJ68	235 aa		13.77	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	GBF1	Q92538	1859 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L5	A8MUK1	530 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	IGHA2	P01877	340 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	FAAP100	Q0VG06	881 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	NBR1	Q14596	966 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	RAB30	Q15771	203 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	FBXO3	Q9UK99	471 aa		13.76	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	HOXC6	P09630	235 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	ACR	P10323	421 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	PTPRE	P23469	700 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	GNAI1	P63096	354 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	LRRC24	Q50LG9	513 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	METTL24	Q5JXM2	366 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	PHF24	Q9UPV7	400 aa		13.75	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	MYO9B	Q13459	2157 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	CNMD	O75829	334 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	FLII	Q13045	1269 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		13.74	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	RFXAP	O00287	272 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	SEPT4	O43236	478 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	TBC1D12	O60347	775 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms