RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	TEPSIN	Q96N21	525 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ENTPD3	O75355	529 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	MAP2K2	P36507	400 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ZAP70	P43403	619 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	HUNK	P57058	714 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	NOG	Q13253	232 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	CCDC102A	Q96A19	550 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	BTD	P43251	543 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	VEGFB	P49765	207 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K12	Q12852	859 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	RGMB	Q6NW40	437 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	SMC5	Q8IY18	1101 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	FAM151A	Q8WW52	585 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	CAPNS2	Q96L46	248 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	HAUS7	Q99871	368 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	RAI14	Q9P0K7	980 aa		10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	APBB1	O00213	710 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	BAG3	O95817	575 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	RHBDL3	P58872	404 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	SNRK	Q9NRH2	765 aa		10.16	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ERC2	O15083	957 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ADH1B	P00325	375 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	DCAF15	Q66K64	600 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	DLK2	Q6UY11	383 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TICAM2	Q86XR7	235 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	PXYLP1	Q8TE99	480 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		10.15	□□□□□ -0.78
USP34-208	ENST00000467128	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CA12	O43570	354 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	GDF9	O60383	454 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	MX1	P20591	662 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CACNB3	P54284	484 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PRR20E	P86478	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PRR20C	P86479	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PRR20D	P86480	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PRR20B	P86481	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PRR20A	P86496	221 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	NFIA	Q12857	509 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	10.14	□□□□□ -0.79	3e-8	■■■□□ 17.3
USP34-208	ENST00000467128	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		10.14	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	GOLIM4	O00461	696 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PDE6A	P16499	860 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	RGS3	P49796	1198 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	UBE3C	Q15386	1083 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		10.13	□□□□□ -0.79
USP34-208	ENST00000467128	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79

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