RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462694.1

PTEN-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 2

Gene PTEN, Length 383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-202ENST00000462694 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 UBXN4Q92575 508 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 SHDQ96IW2 340 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 FBRSQ9HAH7 460 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 LGR6Q9HBX8 967 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 USP35Q9P2H5 1018 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 TJP2Q9UDY2 1190 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.41□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 GIPRP48546 466 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 FAM13CQ8NE31 585 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 TMEM87BQ96K49 555 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 KLHL3Q9UH77 587 aa7.4□□□□□ -1.22
PTEN-202ENST00000462694 HMX2A2RU54 273 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 STK10O94804 968 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 NFICP08651 508 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 SLFN12Q8IYM2 578 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.39□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 SLC22A31A6NKX4 558 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 LRIG2O94898 1065 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 NKG7Q16617 165 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CDCP2Q5VXM1 449 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 PAOXQ6QHF9 649 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ARMCX6Q7L4S7 300 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CLEC10AQ8IUN9 316 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 TM9SF2Q99805 663 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 FOXQ1Q9C009 403 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 MRVI1Q9Y6F6 885 aa7.38□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 DNAJA2O60884 412 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 TNNI3KQ59H18 835 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 FBXL6Q8N531 539 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 MFSD2AQ8NA29 543 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ATG4CQ96DT6 458 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 FAM83CQ9BQN1 747 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 C7orf69Q9H7B7 122 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.37□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 RAG1P15918 1043 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 FSTP19883 344 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ETFBP38117 255 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ARSHQ5FYA8 562 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.36□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 TNFRSF10CO14798 259 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 ADAM23O75077 832 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 GUCY2CP25092 1073 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 PHACTR4Q8IZ21 702 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CCDC74BQ96LY2 380 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 MFSD14AQ96MC6 490 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 IGSF3O75054 1194 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 CCNFP41002 786 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 RBL2Q08999 1139 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 SOGA3Q5TF21 947 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 NBPF6Q5VWK0 638 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 NBPF4Q96M43 638 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 TBC1D32Q96NH3 1257 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 C1GALT1Q9NS00 363 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.34□□□□□ -1.23
PTEN-202ENST00000462694 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 GSC2O15499 205 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 CASP7P55210 303 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 NFIAQ12857 509 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 XAGE3Q8WTP9 111 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 PRDM10Q9NQV6 1147 aa7.33□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
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