RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462357.1

IMP4-209, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 5

Gene IMP4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-209ENST00000462357 GSG1L2A8MUP6 293 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 C19orf81C9J6K1 198 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 TBC1D8O95759 1140 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 CHGBP05060 677 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF6Q15052 776 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 CTR9Q6PD62 1173 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 WDR18Q9BV38 432 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 TMOD4Q9NZQ9 345 aa24.58■■□□□ 1.53
IMP4-209ENST00000462357 M0R2C6 588 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 SDSP20132 328 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 GABPAQ06546 454 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 SPP2Q13103 211 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 MKNK2Q9HBH9 465 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.57■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 MINDY4BA8MYZ0 360 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 GDF11O95390 407 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 GH2P01242 217 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 TTC22Q5TAA0 569 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PTPN18Q99952 460 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 DNAJC18Q9H819 358 aa24.56■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 BTBD19C9JJ37 291 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 USP17L10C9JJH3 530 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 SLURP2P0DP57 97 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 RAB3GAP1Q15042 981 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PNMA3Q9UL41 463 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.55■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 GPR25O00155 361 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PDHXO00330 501 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 SHMT1P34896 483 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 USP14P54578 494 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PDE4BQ07343 736 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 C16orf86Q6ZW13 317 aa24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 FKTNO75072 461 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 PDE4AP27815 886 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 CDK8P49336 464 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 BACE1P56817 501 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 FEZ1Q99689 392 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 SH2D4AQ9H788 454 aa24.53■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 MYH7P12883 1935 aa24.53■■□□□ 1.52
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IMP4-209ENST00000462357 CYP2D6P10635 497 aa24.52■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 CRHR2Q13324 411 aa24.52■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 FAM43AQ8N2R8 423 aa24.52■■□□□ 1.52
IMP4-209ENST00000462357 MYH1P12882 1939 aa24.51■■□□□ 1.51
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IMP4-209ENST00000462357 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
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IMP4-209ENST00000462357 SH3D19Q5HYK7 790 aa24.51■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.51■■□□□ 1.51
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IMP4-209ENST00000462357 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.51■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 FAM227BQ96M60 508 aa24.51■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.51■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 TLR2O60603 784 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 ALX1Q15699 326 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 ERO1AQ96HE7 468 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 CCDC171Q6TFL3 1326 aa24.5■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 HMGCS2P54868 508 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 SP3Q02447 781 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 MTMR2Q13614 643 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 KANSL2Q9H9L4 492 aa24.49■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.48■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 A0A0D9SFI3 127 aa24.48■■□□□ 1.51
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IMP4-209ENST00000462357 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 PPARAQ07869 468 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 PPP4R2Q9NY27 417 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa24.47■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 SEPT2Q15019 361 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.46■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 DOCK1Q14185 1865 aa24.45■■□□□ 1.51
IMP4-209ENST00000462357 NAV1Q8NEY1 1877 aa24.45■■□□□ 1.51
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