RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460331.5

ZNF3-211, Transcript of zinc finger protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF3, Length 562 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF3-211ENST00000460331 CDCA5Q96FF9 252 aa14.7□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TMEM87BQ96K49 555 aa14.7□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 KIF2CQ99661 725 aa14.7□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 INCENPQ9NQS7 918 aa14.7□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 GINM1Q9NU53 330 aa14.7□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.7□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ZSWIM5Q9P217 1185 aa14.7□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 PRC1O43663 620 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ANKRD1Q15327 319 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TMTC2Q8N394 836 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 UBAC1Q9BSL1 405 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 DNAJC18Q9H819 358 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.69□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 FAM196BA6NMK8 535 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 CAP2P40123 477 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 MCM2P49736 904 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TMEM179Q6ZVK1 233 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TTC14Q96N46 770 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 KIF3CO14782 793 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ASNSP08243 561 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 CPA1P15085 419 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 AKR1B1P15121 316 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 FKBP1BP68106 108 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 WTAPQ15007 396 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TMEM67Q5HYA8 995 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 DGKHQ86XP1 1220 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 FBXL16Q8N461 479 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 SMC1BQ8NDV3 1235 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 SIPA1L1O43166 1804 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 UNCXA6NJT0 531 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 USP2O75604 605 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TOMM70O94826 608 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 GDF11O95390 407 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 LIFRP42702 1097 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ANTXR2P58335 489 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 MAP3K9P80192 1104 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 PRKG1Q13976 671 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 Q6ZUG5 572 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 CHST3Q7LGC8 479 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 C2orf69Q8N8R5 385 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 KLRG1Q96E93 195 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 WRNIP1Q96S55 665 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 TNKSO95271 1327 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF3-211ENST00000460331 CCDC69A6NI79 296 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 TRAF5O00463 557 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 GH2P01242 217 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 SLURP2P0DP57 97 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 MAP3K11Q16584 847 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ANKS1AQ92625 1134 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 TCEANC2Q96MN5 208 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 PICK1Q9NRD5 415 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 STX8Q9UNK0 236 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 CSADQ9Y600 493 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 MYH8P13535 1937 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 TTLL1O95922 423 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 INPP5BP32019 993 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 AK2P54819 239 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 SEPT2Q15019 361 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 DLK2Q6UY11 383 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF3-211ENST00000460331 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14 ms