RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421202.5

CCDC18-AS1-205, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC18-AS1, Length 2,973 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SENP7Q9BQF6 1050 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POLIQ9UNA4 740 aa7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 V9GY48 417 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM13AO94988 1023 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PRKAR2BP31323 418 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.245e-7■■■■□ 24.6
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PAK2Q13177 524 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 E2F5Q15329 346 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTPRNQ16849 979 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LINC01559Q495D7 138 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 THAP11Q96EK4 314 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MAP7D2Q96T17 732 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C22orf23Q9BZE7 217 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 USP3Q9Y6I4 520 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TPM2P07951 284 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 YY1P25490 414 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SWAP70Q9UH65 585 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ATP10DQ9P241 1426 aa7.3□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AMPD3Q01432 767 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PLEKHG6Q3KR16 790 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SKILP12757 684 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ERFEQ4G0M1 354 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FOXJ1Q92949 421 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CARMIL3Q8ND23 1372 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZPR1O75312 459 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SOGA3Q5TF21 947 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PAGR1Q9BTK6 254 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BTBD11A6QL63 1104 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MMP10P09238 476 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GNA15P30679 374 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ETFBP38117 255 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 DNAJC10Q8IXB1 793 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ABCF2Q9UG63 623 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF652Q9Y2D9 606 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 JUNDP17535 347 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IFT88Q13099 833 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 USPL1Q5W0Q7 1092 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 STYK1Q6J9G0 422 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C16orf46Q6P387 395 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PDILTQ8N807 584 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CRELD1Q96HD1 420 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PHACTR3Q96KR7 559 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 VPS33BQ9H267 617 aa7.28□□□□□ -1.24
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF853P0CG23 659 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SCNN1DP51172 638 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BIRC2Q13490 618 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 RUNDC1Q96C34 613 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 BRIP1Q9BX63 1249 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 OSBPL7Q9BZF2 842 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POTEIP0CG38 1075 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 POTEJP0CG39 1038 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 KCNA3P22001 575 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 C16orf87Q6PH81 154 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 SCYL1Q96KG9 808 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 MUC3BQ9H195 1237 aa7.27□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CBFA2T2O43439 604 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 CAMTA2O94983 1202 aa7.26□□□□□ -1.25
CCDC18-AS1-205ENST00000421202 ABCD1P33897 745 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 118.9 ms