RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 PPARAQ07869 468 aa35.88■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 NOGQ13253 232 aa35.88■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP35.88■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 STK11IPQ8N1F8 1099 aa35.88■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 OTUD5Q96G74 571 aa35.88■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa35.88■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 PICK1Q9NRD5 415 aa35.87■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 THSD7BQ9C0I4 1608 aa35.87■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 PHIPQ8WWQ0 1821 aa35.86■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 PTPRAP18433 802 aa35.86■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 PPATQ06203 517 aa35.85■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 MAP2K2P36507 400 aa35.84■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 PTH1RQ03431 593 aa35.84■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP35.84■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 ANAPC4Q9UJX5 808 aa35.84■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 ASNSP08243 561 aa35.83■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP35.83■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 CTDSPL2Q05D32 466 aa35.83■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa35.83■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 ZHX2Q9Y6X8 837 aa35.83■■■■□ 3.33
PKDCC-202ENST00000401498 IRF6O14896 467 aa35.82■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 GH2P01242 217 aa35.82■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 PPIL2Q13356 520 aa35.82■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 CASC1Q6TDU7 716 aa35.82■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 GINM1Q9NU53 330 aa35.82■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 ABCB5Q2M3G0 1257 aa35.81■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 HAND2P61296 217 aa35.8■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 MKNK2Q9HBH9 465 aa35.8■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 TACC3Q9Y6A5 838 aa35.8■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 LAMA4Q16363 1823 aa35.79■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 PRDM1O75626 825 aa35.79■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP35.79■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 AKR1B1P15121 316 aa35.79■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 JMYQ8N9B5 988 aa35.79■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 NBPF3Q9H094 633 aa35.79■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa35.79■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L5A8MUK1 530 aa35.78■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 RASA1P20936 1047 aa35.78■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 GUCY1A2P33402 732 aa35.78■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 MS4A4AQ96JQ5 239 aa35.78■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 CABP5Q9NP86 173 aa35.78■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 INCENPQ9NQS7 918 aa35.78■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 PDE4BQ07343 736 aa35.77■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 MAP4K1Q92918 833 aa35.77■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 CCDC17Q96LX7 622 aa35.77■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP35.77■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 CTNNA3Q9UI47 895 aa35.77■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 KCNH4Q9UQ05 1017 aa35.77■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP35.76■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF287Q9HBT7 754 aa35.76■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.32
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF213O14771 459 aa35.76■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa35.76■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 PTPRFP10586 1907 aa35.75■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP35.75■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 FGRP09769 529 aa35.75■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 SEPT2Q15019 361 aa35.75■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 RAB3GAP1Q15042 981 aa35.75■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 GTF2A2P52657 109 aa35.74■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 CXCL11O14625 94 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 SNAPC2Q13487 334 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM179Q6ZVK1 233 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D10CQ8IV04 446 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF280CQ8ND82 737 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 WDR18Q9BV38 432 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D2Q9BYX2 928 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 ANO2Q9NQ90 1003 aa35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM75PA6NK02 468 aa35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 TM4SF4P48230 202 aa35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 SPP2Q13103 211 aa35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 AS3MTQ9HBK9 375 aa35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP35.72■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 INHBEP58166 350 aa35.71■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 AKNAD1Q5T1N1 836 aa35.71■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 BRI3BPQ8WY22 251 aa35.71■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 ORC4O43929 436 aa35.7■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 SREBF2Q12772 1141 aa35.7■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 STAG1Q8WVM7 1258 aa35.7■■■■□ 3.31
PKDCC-202ENST00000401498 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa35.69■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 CCL15Q16663 113 aa35.69■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 PTPN18Q99952 460 aa35.69■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 CYP21A2P08686 494 aa35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 CETPP11597 493 aa35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 MOGSQ13724 837 aa35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 FAM47AQ5JRC9 791 aa35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 CLEC10AQ8IUN9 316 aa35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 MFSD6Q6ZSS7 791 aa35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP35.68■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 TFAP4Q01664 338 aa35.67■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 SIAH1Q8IUQ4 282 aa35.67■■■■□ 3.3
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