RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.24□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 TJP2Q9UDY2 1190 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 DNAJA2O60884 412 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 STK10O94804 968 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRIG2O94898 1065 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 CST3P01034 146 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 ITGB2P05107 769 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 RAG1P15918 1043 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP4.23□□□□□ -1.73
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RNU6-78P-201ENST00000362897 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU6-78P-201ENST00000362897 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.23□□□□□ -1.73
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RNU6-78P-201ENST00000362897 H2AFB1P0C5Y9 115 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-78P-201ENST00000362897 H2AFB2P0C5Z0 115 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM87AP0C7U9 286 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-78P-201ENST00000362897 GBP1P32455 592 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-78P-201ENST00000362897 ETV3P41162 512 aa4.19□□□□□ -1.74
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RNU6-78P-201ENST00000362897 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-78P-201ENST00000362897 TTC6Q86TZ1 520 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-78P-201ENST00000362897 FBXL6Q8N531 539 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU6-78P-201ENST00000362897 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
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