RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.88■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CASP14P31944 242 aa21.88■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ZNF827Q17R98 1081 aa21.88■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.88■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 NOSTRINQ8IVI9 506 aa21.88■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ERLIN2O94905 339 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP25P42331 645 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 TRIM14Q14142 442 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 LRP10Q7Z4F1 713 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 MICALL1Q8N3F8 863 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CPLX3Q8WVH0 158 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 GYPCP04921 128 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 STIM1Q13586 685 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 SART3Q15020 963 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 WASHC4Q2M389 1173 aa21.87■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 RILPL1Q5EBL4 403 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 APOA5Q6Q788 366 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ACRBPQ8NEB7 543 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 WASF1Q92558 559 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 APPBP2Q92624 585 aa21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 EBAG9O00559 213 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 GSCP56915 257 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 FAM76AQ8TAV0 307 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CRACR2AQ9BSW2 395 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 PSMD14O00487 310 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CIAO1O76071 339 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 FOXO4P98177 505 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 NTRK3Q16288 839 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 NBPF14Q5TI25 921 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 POTEDQ86YR6 584 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ABHD10Q9NUJ1 306 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CEP131Q9UPN4 1083 aa21.85■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ABCC12Q96J65 1359 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CUL4BQ13620 913 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 SPECC1Q5M775 1068 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 GPATCH11Q8N954 259 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 PHKBQ93100 1093 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 TMEM87BQ96K49 555 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 EYA2O00167 538 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 EXOC5O00471 708 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 PSEN1P49768 467 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 GBP6Q6ZN66 633 aa21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB43O43298 467 aa21.83■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 ERVK-24P63145 666 aa21.83■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 E2F4Q16254 413 aa21.83■■□□□ 1.09
NOP56-201ENST00000329276 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 MYH8P13535 1937 aa21.82■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 A6NNZ2 444 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 H7C1W4 665 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 PPFIA1Q13136 1202 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 TUBB8Q3ZCM7 444 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 RPAINQ86UA6 219 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 SGMS1Q86VZ5 419 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 HAUS4Q9H6D7 363 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 MST1RQ04912 1400 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 LRRC10BA6NIK2 292 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 MMP1P03956 469 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 GSDMAQ96QA5 445 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 PHF8Q9UPP1 1060 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 SAR1BQ9Y6B6 198 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 FAM169AQ9Y6X4 670 aa21.81■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA6CA6NDK9 693 aa21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA6DP0CG33 693 aa21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 GGCXP38435 758 aa21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 IRAK1P51617 712 aa21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 SPAG1Q07617 926 aa21.8■■□□□ 1.08
NOP56-201ENST00000329276 MICU3Q86XE3 530 aa21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms