RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324394.7

ZNF404-201, Transcript of zinc finger protein 404, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF404, Length 1,844 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF404-201ENST00000324394 GMIPQ9P107 970 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SIRPGQ9P1W8 387 aa6.29□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 UPK3BL1B0FP48 263 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 UPK3BL2E5RIL1 263 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 FANCGO15287 622 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ALX3O95076 343 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 ACRP10323 421 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TTLL4Q14679 1199 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 TM9SF2Q99805 663 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 FBRSQ9HAH7 460 aa6.28□□□□□ -1.4
ZNF404-201ENST00000324394 A0A1W2PQH9 124 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TIAF1O95411 115 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 NEFMP07197 916 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 GUCY2CP25092 1073 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 MLECQ14165 292 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 NFE2L2Q16236 605 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 DYMQ7RTS9 669 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 UBE3DQ7Z6J8 389 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TTC6Q86TZ1 520 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 RNF214Q8ND24 703 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TJP2Q9UDY2 1190 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 FAM86C2PA6NEL3 165 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 NME1P15531 152 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 RASA3Q14644 834 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 NKG7Q16617 165 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 DDR2Q16832 855 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ARSHQ5FYA8 562 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 LCE1DQ5T752 114 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 NLRC3Q7RTR2 1065 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM130Q8N3G9 435 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 MKL1Q969V6 931 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 SNTG2Q9NY99 539 aa6.27□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 CADPSQ9ULU8 1353 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TLDC2A0PJX2 215 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 F8W735 103 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 FDX2Q6P4F2 183 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 SLC9A7Q96T83 725 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ATXN3LQ9H3M9 355 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 CNNM2Q9H8M5 875 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 FAM105AQ9NUU6 356 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TBX22Q9Y458 520 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ACTL7BQ9Y614 415 aa6.26□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ASPAP45381 313 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 FXNQ16595 210 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 UNC5AQ6ZN44 842 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 JAZF1Q86VZ6 243 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 HID1Q8IV36 788 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 FAM13CQ8NE31 585 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ISL2Q96A47 359 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TMEM87BQ96K49 555 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 B2RBV5 119 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TNFRSF10CO14798 259 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 GJB6O95452 261 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 PREPP48147 710 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 SLFN12Q8IYM2 578 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 USP21Q9UK80 565 aa6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 DYRK3O43781 588 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 COBLO75128 1261 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 DDAH1O94760 285 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 ANKRD34AQ69YU3 496 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 PIDD1Q9HB75 910 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.24□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 RAG1P15918 1043 aa6.23□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 YARSP54577 528 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ZNF404-201ENST00000324394 LRP8Q14114 963 aa6.23□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.3 ms