RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.44■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 MYSM1Q5VVJ2 828 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 MKNK2Q9HBH9 465 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 QSER1Q2KHR3 1735 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM29Q14134 588 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 BICD2Q8TD16 824 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 CNKSR1Q969H4 720 aa26.43■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.42■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 PPP2R5BQ15173 497 aa26.42■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 WASF1Q92558 559 aa26.42■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 TSPY26PQ9H489 355 aa26.42■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 RTEL1Q9NZ71 1219 aa26.41■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 CLIC4Q9Y696 253 aa26.41■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 RCSD1Q6JBY9 416 aa26.41■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.41■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.41■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 DACT1Q9NYF0 836 aa26.41■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 DDAH1O94760 285 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 PLEKHA8P1O95397 391 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 DEXIO95424 95 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 SCNN1DP51172 638 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 PODNQ7Z5L7 613 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 CALM1P0DP23 149 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 CALM2P0DP24 149 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 CALM3P0DP25 149 aa26.4■■□□□ 1.82
VSTM4-201ENST00000298454 NR1I2O75469 434 aa26.39■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 FUT2Q10981 343 aa26.39■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 KCNJ14Q9UNX9 436 aa26.39■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L3A6NCW0 530 aa26.38■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L4A6NCW7 530 aa26.38■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L1Q7RTZ2 530 aa26.38■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 LINC00301Q8NCQ3 95 aa26.38■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 RNF214Q8ND24 703 aa26.38■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
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VSTM4-201ENST00000298454 TSPY3P0CV98 308 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 TSPY8P0CW00 308 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 ME1P48163 572 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 PICALMQ13492 652 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 CAMK4Q16566 473 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 POLR3EQ9NVU0 708 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 RASA1P20936 1047 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 C16orf86Q6ZW13 317 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 NUP62CLQ9H1M0 184 aa26.37■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 ECE2O60344 883 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 MMP1P03956 469 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 CDK8P49336 464 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 NT5C2P49902 561 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 DGKHQ86XP1 1220 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 STK38Q15208 465 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 TMTC3Q6ZXV5 915 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHA7Q9UN72 937 aa26.36■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 PKN1Q16512 942 aa26.35■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 AOC3Q16853 763 aa26.35■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 KAT14Q9H8E8 782 aa26.35■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 YEATS4O95619 227 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 ANO1Q5XXA6 986 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 FUCA2Q9BTY2 467 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 SNED1Q8TER0 1413 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 BTBD18B2RXH4 712 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 C21orf2O43822 256 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
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VSTM4-201ENST00000298454 ZNF287Q9HBT7 754 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 USP40Q9NVE5 1235 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 C10orf71Q711Q0 1435 aa26.34■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 ANKS1AQ92625 1134 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 TEKT1Q969V4 418 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 HHIPL2Q6UWX4 724 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 KCNG4Q8TDN1 519 aa26.33■■□□□ 1.81
VSTM4-201ENST00000298454 SPTLC2O15270 562 aa26.32■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP26.32■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 DACT2Q5SW24 774 aa26.32■■□□□ 1.8
VSTM4-201ENST00000298454 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
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