RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270645.7

RCN3-201, Transcript of reticulocalbin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RCN3, Length 1,859 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3-201ENST00000270645 WASF1Q92558 559 aa23.96■■□□□ 1.43
RCN3-201ENST00000270645 C21orf2O43822 256 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 SCNN1DP51172 638 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 DACT2Q5SW24 774 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 KRT40Q6A162 431 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RCSD1Q6JBY9 416 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 TRIM22Q8IYM9 498 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 MRIQ9BWK5 157 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RCOR1Q9UKL0 485 aa23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 KCNA3P22001 575 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 AOC3Q16853 763 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 TPRNQ4KMQ1 711 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 GRIPAP1Q4V328 841 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 C16orf86Q6ZW13 317 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 BRAPQ7Z569 592 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 SLC44A5Q8NCS7 719 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 ANKS1AQ92625 1134 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 GRPEL1Q9HAV7 217 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 DGKHQ86XP1 1220 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP23.94■■□□□ 1.421e-6■■■■□ 25.6
RCN3-201ENST00000270645 TEKT1Q969V4 418 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 USP28Q96RU2 1077 aa23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 SYCE3A1L190 88 aa23.93■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RASA1P20936 1047 aa23.93■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 GUCY1A2P33402 732 aa23.93■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CCDC178Q5BJE1 867 aa23.93■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.93■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 USP40Q9NVE5 1235 aa23.93■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 USP17L3A6NCW0 530 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 USP17L4A6NCW7 530 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 KIF28PB7ZC32 967 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 DEXIO95424 95 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 DPEP1P16444 411 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CDK8P49336 464 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 FUT2Q10981 343 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CCDC82Q8N4S0 544 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 PGBD1Q96JS3 809 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 TRIM29Q14134 588 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 LRSAM1Q6UWE0 723 aa23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 FOCADQ5VW36 1801 aa23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 TSPY3P0CV98 308 aa23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 TSPY8P0CW00 308 aa23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CRKP46108 304 aa23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 ZDHHC15Q96MV8 337 aa23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RTEL1Q9NZ71 1219 aa23.91■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 CCDC93Q567U6 631 aa23.9■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 RTKN2Q8IZC4 609 aa23.9■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 ECM29Q5VYK3 1845 aa23.9■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa23.9■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.9■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 SCN9AQ15858 1988 aa23.89■■□□□ 1.42
RCN3-201ENST00000270645 PPIP5K2O43314 1243 aa23.89■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 PLEKHA8P1O95397 391 aa23.89■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 PICALMQ13492 652 aa23.89■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 TMTC3Q6ZXV5 915 aa23.89■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.89■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 KAT14Q9H8E8 782 aa23.89■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 MYH1P12882 1939 aa23.88■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.88■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 PSMD1Q99460 953 aa23.88■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 LIG1P18858 919 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 MAP3K14Q99558 947 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 YDJCA8MPS7 323 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 ZBTB7AO95365 584 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 GABPAQ06546 454 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 PKN1Q16512 942 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.87■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 MMP1P03956 469 aa23.86■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.86■■□□□ 1.41
RCN3-201ENST00000270645 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms