RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 ELNP15502 786 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 UBXN2AP68543 259 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 NUCB2P80303 420 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC4A10Q6U841 1118 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 C17orf99Q6UX52 265 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM161BQ96MY7 647 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB118Q96PH6 123 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 OSBPL3Q9H4L5 887 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 GABRQQ9UN88 632 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 RPTORQ8N122 1335 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 ADGRA2Q96PE1 1338 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 IRS2Q9Y4H2 1338 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-201ENST00000264640 ERC2O15083 957 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB11FIP3O75154 756 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TAF5LO75529 589 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 INHAP05111 366 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 HOXD10P28358 340 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 BMP8BP34820 402 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MCM2P49736 904 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 FLIIQ13045 1269 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 SNAPC2Q13487 334 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFAIP1Q13829 316 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TDHQ8IZJ6 230 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 DDX12PQ92771 950 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 GUCD1Q96NT3 240 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 WRNIP1Q96S55 665 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MYH13Q9UKX3 1938 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PDHXO00330 501 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ADCY3O60266 1144 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAK2O60296 914 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 CACNB3P54284 484 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP8B2P98198 1209 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 CHRNDQ07001 517 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 LRIT3Q3SXY7 679 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ERO1BQ86YB8 467 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MEIS3Q99687 375 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRCC1Q9C099 1032 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 FRMPD3Q5JV73 1810 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGA6P23229 1130 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 FCGRTP55899 365 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PPIL2Q13356 520 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MPHOSPH8Q99549 860 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 USP26Q9BXU7 913 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD2Q9GZV1 360 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 CDH23Q9H251 3354 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 DOCK2Q92608 1830 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MAST2Q6P0Q8 1798 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MUC3AQ02505 3323 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV5-2P06315 115 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2C8P10632 490 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 IL1R1P14778 569 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 SDSP20132 328 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 DDIT3P35638 169 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 FLT3LGP49771 235 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MRE11P49959 708 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PDE1AP54750 535 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZNB5 142 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF804AQ7Z570 1209 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 NECAB2Q7Z6G3 386 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PACS2Q86VP3 889 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PLXNB2O15031 1838 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 LTBP2Q14767 1821 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 PHIPQ8WWQ0 1821 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 INPP5BP32019 993 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 TNNI2P48788 182 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ANAPC15P60006 121 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 GRIK5Q16478 980 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 CLEC17AQ6ZS10 378 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 MIGA2Q7L4E1 593 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKRD23Q86SG2 305 aa8.42□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 DOCK1Q14185 1865 aa8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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