RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 JAG1P78504 1218 aa25.22■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 GABPAQ06546 454 aa25.22■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 CTR9Q6PD62 1173 aa25.22■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 FKTNO75072 461 aa25.21■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 CAP2P40123 477 aa25.21■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 C12orf60Q5U649 245 aa25.21■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.21■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa25.21■■□□□ 1.63
COX5B-201ENST00000258424 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 IRF6O14896 467 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 GDF11O95390 407 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 PTPRAP18433 802 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 SHMT1P34896 483 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 PPATQ06203 517 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 PPIL2Q13356 520 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 VPS53Q5VIR6 699 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.2■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 IFNL3Q8IZI9 196 aa25.19■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.19■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 PICK1Q9NRD5 415 aa25.19■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.19■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.19■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 APPP05067 770 aa25.18■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.18■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.17■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 TDO2P48775 406 aa25.17■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 SBK1Q52WX2 424 aa25.17■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.17■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 HIP1O00291 1037 aa25.16■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 SOX10P56693 466 aa25.16■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 AMOTL1Q8IY63 956 aa25.16■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.16■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 IL25Q9H293 177 aa25.16■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.16■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.16■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 GTF2A2P52657 109 aa25.15■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 PTPN18Q99952 460 aa25.15■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.15■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.15■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 MINDY4BA8MYZ0 360 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 SNAPC2Q13487 334 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 CCL15Q16663 113 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 NACAP1Q9BZK3 213 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 NAPBQ9H115 298 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 SWAP70Q9UH65 585 aa25.14■■□□□ 1.62
COX5B-201ENST00000258424 GH2P01242 217 aa25.13■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 ASNSP08243 561 aa25.13■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 CHMLP26374 656 aa25.13■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 CDK8P49336 464 aa25.13■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.13■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 MOGSQ13724 837 aa25.12■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.12■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.12■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 LAMA4Q16363 1823 aa25.12■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 TRIM75PA6NK02 468 aa25.11■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 USP17L5A8MUK1 530 aa25.11■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 CETPP11597 493 aa25.11■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.11■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 BMP2KLQ5H9B9 411 aa25.11■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 GINM1Q9NU53 330 aa25.11■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 CXCL11O14625 94 aa25.1■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 GUCY1A2P33402 732 aa25.1■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 ALX1Q15699 326 aa25.1■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 AKR1B1P15121 316 aa25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 PPARAQ07869 468 aa25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 SPP2Q13103 211 aa25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 CRHR2Q13324 411 aa25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.09■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 BTBD19C9JJ37 291 aa25.08■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 FGAP02671 866 aa25.08■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 ERO1AQ96HE7 468 aa25.08■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 WDR18Q9BV38 432 aa25.08■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.08■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 TRIM17Q9Y577 477 aa25.08■■□□□ 1.61
COX5B-201ENST00000258424 ZMYM6O95789 1325 aa25.08■■□□□ 1.6
COX5B-201ENST00000258424 RAD50Q92878 1312 aa25.08■■□□□ 1.6
COX5B-201ENST00000258424 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
COX5B-201ENST00000258424 SEPT2Q15019 361 aa25.07■■□□□ 1.6
COX5B-201ENST00000258424 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.07■■□□□ 1.6
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