RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000155840.9

KCNQ1-201, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 3,245 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-201ENST00000155840 LAMA4Q16363 1823 aa19.77■□□□□ 0.76
KCNQ1-201ENST00000155840 CYP2C19P33261 490 aa19.77■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 RASGRF1Q13972 1273 aa19.77■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FOXR1Q6PIV2 292 aa19.77■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PNKPQ96T60 521 aa19.77■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PLEKHA8P1O95397 391 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MPHOSPH8Q99549 860 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 N4BP3O15049 544 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MCM7P33993 719 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 UIMC1Q96RL1 719 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 POLD4Q9HCU8 107 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAMTS3O15072 1205 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 DNA2P51530 1060 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 RASGRP4Q8TDF6 673 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 DRC1Q96MC2 740 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PSMB7Q99436 277 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa19.76■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CCDC175P0C221 793 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 KCNQ4P56696 695 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 DPYDQ12882 1025 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 RRAGBQ5VZM2 374 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR108Q9NPR9 543 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PPP6R2O75170 966 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MMP1P03956 469 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 HSPA2P54652 639 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 GOLGA1Q92805 767 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MRFAP1Q9Y605 127 aa19.75■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 BICDL1Q6ZP65 573 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 KIF5CO60282 957 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM47AQ5JRC9 791 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 SPATA5Q8NB90 893 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ABCB6Q9NP58 842 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CCP110O43303 1012 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MAP3K9P80192 1104 aa19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM49BA6NDI0 452 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PDE8BO95263 885 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ADAM21Q9UKJ8 722 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FAN1Q9Y2M0 1017 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ARHGAP23Q9P227 1491 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CYP7A1P22680 504 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ZSCAN26Q16670 478 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 AKNAD1Q5T1N1 836 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CHP1Q99653 195 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa19.73■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CIAO1O76071 339 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ZNF654Q8IZM8 581 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PIGBQ92521 554 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 GSG1L2A8MUP6 293 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 KIFC2Q96AC6 838 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 SHISA4Q96DD7 197 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 GDAQ9Y2T3 454 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CPDO75976 1380 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 GYG1P46976 350 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CTSWP56202 376 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 MAP3K12Q12852 859 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 NLRP10Q86W26 655 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.72■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ADGRA1Q86SQ6 560 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FANCBQ8NB91 859 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FUT8Q9BYC5 575 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 PP2D1A8MPX8 630 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 STX10O60499 249 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 SART3Q15020 963 aaKnown RBP19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ACSBG1Q96GR2 724 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 ADGRG1Q9Y653 693 aa19.71■□□□□ 0.75
KCNQ1-201ENST00000155840 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 PTPREP23469 700 aa19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 VSNL1P62760 191 aa19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 TRIM75PA6NK02 468 aa19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 FAM53CQ9NYF3 392 aa19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 TNKSO95271 1327 aa19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP19.7■□□□□ 0.74
KCNQ1-201ENST00000155840 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms