RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 SLX4Q8IY92 1834 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 RHBDL3P58872 404 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 STK32BQ9NY57 414 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM22Q8IYM9 498 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 NUP62CLQ9H1M0 184 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa21.6■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 GAKO14976 1311 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 H0YIN7 160 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 ME1P48163 572 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 TFAP4Q01664 338 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 TRIM29Q14134 588 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 FUCA2Q9BTY2 467 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.59■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 KCNQ5Q9NR82 932 aa21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 MYH6P13533 1939 aa21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 FLT1P17948 1338 aa21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
SIKE1-201ENST00000060969 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 DBNDD1Q9H9R9 158 aa21.58■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.58■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.58■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa21.58■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 FUT2Q10981 343 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 DEFB132Q7Z7B7 95 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 CKAP2LQ8IYA6 745 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 OFD1O75665 1012 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 DEXIO95424 95 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 STK38Q15208 465 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 RGS22Q8NE09 1264 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 SHISA4Q96DD7 197 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.57■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 USP17L3A6NCW0 530 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 USP17L4A6NCW7 530 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 USP17L1Q7RTZ2 530 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 AMOTL1Q8IY63 956 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 WASF1Q92558 559 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 TNMDQ9H2S6 317 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 CLSTN2Q9H4D0 955 aa21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 DDAH1O94760 285 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 SCNN1DP51172 638 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 MAP3K11Q16584 847 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 ANO1Q5XXA6 986 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 STYK1Q6J9G0 422 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 SLF2Q8IX21 1173 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 BTBD18B2RXH4 712 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 G3V3G9 751 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 MMP1P03956 469 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 PLCG2P16885 1265 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 MYH1P12882 1939 aa21.55■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 TPM2P07951 284 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 PKN1Q16512 942 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 CERS3Q8IU89 383 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 SPTLC2O15270 562 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 YEATS4O95619 227 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 PPP2R5BQ15173 497 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 FSIP1Q8NA03 581 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 V9GY48 417 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 QSER1Q2KHR3 1735 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 FOCADQ5VW36 1801 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 CALM1P0DP23 149 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 CALM2P0DP24 149 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 CALM3P0DP25 149 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 RASA1P20936 1047 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 PICALMQ13492 652 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 UVSSAQ2YD98 709 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 EYA3Q99504 573 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 VPS54Q9P1Q0 977 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 TSPY3P0CV98 308 aa21.53■■□□□ 1.04
SIKE1-201ENST00000060969 TSPY8P0CW00 308 aa21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms