RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000054237.13

Dclk1-201, Transcript of Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Dclk1, Length 7,847 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ckap2lQ7TS74 745 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ccdc155Q80VJ8 648 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Sdccag3A2AIW0 432 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Krt4P07744 525 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Gpc4P51655 557 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Hdac4Q6NZM9 1076 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Rassf6Q80UQ2 353 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 TprnA2AI08 749 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Zfp597E9Q6S0 419 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 TxlngQ8BHN1 524 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Mylk2Q8VCR8 613 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Pole3Q9JKP7 145 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Pde3aQ9Z0X4 1141 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Abcc4E9Q236 1325 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Mx1P09922 631 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Parp1P11103 1013 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Casp2P29594 452 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Fam170aQ66LM6 333 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Abtb2Q7TQI7 1024 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 GancQ8BVW0 898 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 4932411N23RikQ8C0S0 470 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Myef2Q8C854 591 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 FanclQ9CR14 375 aa9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 LrpprcQ6PB66 1392 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Akap17bA2A3V1 959 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Adcy8P97490 1249 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 SpertQ32MG2 446 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ccdc189Q6NZQ0 333 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 MgarpQ8VI64 283 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Tnpo2Q99LG2 887 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Kank1E9Q238 1360 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Gm4297D3YWB7 211 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 DgkiD3YWQ0 1071 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Acbd5Q5XG73 508 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Cyth1Q9QX11 398 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Tnip3A0A1D5RMN0 279 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Cep104Q80V31 926 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Aldh8a1Q8BH00 487 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ppme1Q8BVQ5 386 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Tmem143Q8VD26 458 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Osbpl5Q9ER64 874 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Rnf14Q9JI90 485 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Zscan25B2RX31 543 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Nfkbil1O88995 381 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 LifrP42703 1092 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Gm10488Q4KL05 212 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ccdc125Q5U465 500 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Zfp202Q8C879 641 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Med10Q9CXU0 135 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Kif9Q9WV04 790 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ap1b1O35643 943 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 AdpgkQ8VDL4 496 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Cep85lA0A1W2P884 806 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 A630010A05RikA9C473 232 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Prim1P20664 417 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Chpf2Q3UU43 768 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Myl6bQ8CI43 207 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Cd2bp2Q9CWK3 342 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Slc52a2Q9D8F3 450 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Rgs3Q9DC04 966 aa9.49□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Hcls1P49710 486 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Card10P58660 1021 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Wdr36Q3TAQ9 899 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Gm1604bQ3TRG0 118 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 OtulinQ3UCV8 352 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Mrpl12Q9DB15 201 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Strn3Q9ERG2 796 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Gm17615E9Q9P2 165 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Actn3O88990 900 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 F2rP30558 430 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Tor4aQ8BH02 426 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Gnl3Q8CI11 538 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Asxl1P59598 1514 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Pfdn4Q3UWL8 134 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ifit2Q64112 472 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Krt12Q64291 487 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Tti2Q8BGV4 512 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Q8BZJ8 459 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Efcab8Q8C9R9 203 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Serpinb12Q9D7P9 423 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Rlbp1Q9Z275 317 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Tcp1P11983 556 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Kif22Q3V300 660 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Zc3h12cQ5DTV4 884 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Spdl1Q923A2 608 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Eef1gQ9D8N0 437 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Klhl29Q80T74 875 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Dtnbp1Q91WZ8 352 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Tsc1Q9EP53 1161 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ak2Q9WTP6 239 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 ScribQ80U72 1612 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Parp2O88554 559 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Ano9P86044 747 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Trim27Q62158 513 aa9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 Enox1Q8BHR2 643 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
Dclk1-201ENSMUST00000054237 St5Q924W7 1134 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 236.8 ms