RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		6.59	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	6.59	□□□□□ -1.35
EFHC1-223	ENST00000636616	SAMD9	Q5K651	1589 aa		6.59	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC01387	J3KSC0	135 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PRC1	O43663	620 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CDC25B	P30305	580 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	GSTT1	P30711	240 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX9	P48436	509 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CABP4	P57796	275 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	DTHD1	Q6ZMT9	781 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FERMT3	Q86UX7	667 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	DNAJC7	Q99615	494 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF576	Q9H609	170 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	MSRB2	Q9Y3D2	182 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616		H3BRJ5	948 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	HOMER1	Q86YM7	354 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	C3orf58	Q8NDZ4	430 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	C8orf48	Q96LL4	319 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC4M	Q9H2X3	399 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	STRIP2	Q9ULQ0	834 aa		6.58	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGEF11	O15085	1522 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PPFIA4	O75335	1185 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SQSTM1	Q13501	440 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RAVER1	Q8IY67	606 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM260	Q9NX78	707 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		6.57	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PTPRG	P23470	1445 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CLIP1	P30622	1438 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP162	Q5TB80	1403 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FMN1	Q68DA7	1419 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	KIAA0556	O60303	1618 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A0A0MRY4	1105 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDH1	Q08174	1060 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	IKBKE	Q14164	716 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SETDB1	Q15047	1291 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RALBP1	Q15311	655 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TKFC	Q3LXA3	575 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS26P11	Q5JNZ5	115 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM117B	Q6P1L5	589 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	EID1	Q9Y6B2	187 aa		6.56	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616		F6X3S4	739 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FSCN2	O14926	492 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RAC1	P63000	192 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	BIRC2	Q13490	618 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT8B	Q93098	351 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FEZ1	Q99689	392 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		6.55	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM229A	H3BQW9	127 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	DEAF1	O75398	565 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	EVA1C	P58658	441 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	PIP4K2B	P78356	416 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FAAP100	Q0VG06	881 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	FBXO11	Q86XK2	927 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP4K3	Q8IVH8	894 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	HOMER2	Q9NSB8	354 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TM4SF5	O14894	197 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	B3GALT4	O96024	378 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	COL8A1	P27658	744 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF4A3	P38919	411 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	MAP9	Q49MG5	647 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	JAML	Q86YT9	394 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKRD24	Q8TF21	1146 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	TRIM56	Q9BRZ2	755 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
EFHC1-223	ENST00000636616	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		6.54	□□□□□ -1.36

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