RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000633035.1

JMJD1C-211, Transcript of jumonji domain containing 1C, human

TSL 3

Gene JMJD1C, Length 499 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
JMJD1C-211	ENST00000633035	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	20.06	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	PALD1	Q9ULE6	856 aa		20.06	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	DOCK2	Q92608	1830 aa		20.06	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	CXCL11	O14625	94 aa		20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLURP2	P0DP57	97 aa		20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	PTPRA	P18433	802 aa		20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRHR2	Q13324	411 aa		20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ABHD8	Q96I13	439 aa		20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	20.05	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		20.04	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC6	Q86TZ1	520 aa		20.04	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		20.04	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	GCC1	Q96CN9	775 aa		20.04	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	20.04	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		20.04	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	BTBD19	C9JJ37	291 aa		20.03	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERC2	O15083	957 aa		20.03	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	20.03	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ADD2	P35612	726 aa		20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	CAP2	P40123	477 aa		20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	20.02	■□□□□ 0.8
JMJD1C-211	ENST00000633035	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		20.01	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ERO1A	Q96HE7	468 aa		20.01	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		20.01	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		20.01	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		20.01	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		20.01	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM75P	A6NK02	468 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	PDHX	O00330	501 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	SP3	Q02447	781 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARHGEF6	Q15052	776 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	UBE3C	Q15386	1083 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		20	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	USP17L5	A8MUK1	530 aa		19.99	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	19.99	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ASNS	P08243	561 aa		19.99	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		19.99	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ARMT1	Q9H993	441 aa		19.99	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		19.99	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		19.99	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LAMB1	P07942	1786 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TLR2	O60603	784 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	MBD4	O95243	580 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	MX1	P20591	662 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	SPP2	Q13103	211 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	LCORL	Q8N3X6	602 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	GINM1	Q9NU53	330 aa		19.98	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	KIF22	Q14807	665 aa		19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	EHD4	Q9H223	541 aa		19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	TRIM17	Q9Y577	477 aa		19.97	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	19.96	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		19.96	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		19.96	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	19.96	■□□□□ 0.79
JMJD1C-211	ENST00000633035	GDF11	O95390	407 aa		19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	DNAJC18	Q9H819	358 aa		19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	EFCC1	Q9HA90	598 aa		19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	CABP5	Q9NP86	173 aa		19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		19.95	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	DOCK1	Q14185	1865 aa		19.94	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	19.94	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	PLCD1	P51178	756 aa		19.94	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		19.94	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	19.94	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		19.94	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	PRKAB2	O43741	272 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	MOGS	Q13724	837 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		19.93	■□□□□ 0.78
JMJD1C-211	ENST00000633035	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	19.93	■□□□□ 0.78

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