RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631166.1

HS1BP3-208, Transcript of HCLS1 binding protein 3, human

TSL 5 BASIC

Gene HS1BP3, Length 78 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HS1BP3-208	ENST00000631166	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	EP400NL	Q6ZTU2	488 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC105	Q8IYK2	499 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	OPTN	Q96CV9	577 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	SETDB2	Q96T68	719 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	RALGAPA2	Q2PPJ7	1873 aa		3.34	□□□□□ -1.87
HS1BP3-208	ENST00000631166	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		3.34	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	PDZD2	O15018	2839 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	EPOP	A6NHQ4	379 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166		B8ZZF3	427 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CETP	P11597	493 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	MYOG	P15173	224 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	TNFRSF8	P28908	595 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	UBAP2L	Q14157	1087 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	TRIM60	Q495X7	471 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF365	Q70YC5	407 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SUGP2	Q8IX01	1082 aa	Known RBP eCLIP	3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SPATA3	Q8NHX4	192 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	COA7	Q96BR5	231 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	WASF3	Q9UPY6	502 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	NUP155	O75694	1391 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ANKRD30A	Q9BXX3	1397 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		3.33	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	BTBD19	C9JJ37	291 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CYP27B1	O15528	508 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SYNCRIP	O60506	623 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	KCNK5	O95279	499 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CLTB	P09497	229 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ICAM3	P32942	547 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	NEUROD2	Q15784	382 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	PTPN21	Q16825	1174 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	LHX8	Q68G74	356 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZBTB33	Q86T24	672 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CRELD1	Q96HD1	420 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	KDR	P35968	1356 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	3.32	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	DNM1L	O00429	736 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	LPXN	O60711	386 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	FGB	P02675	491 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CA3	P07451	260 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CR2	P20023	1033 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	TLE2	Q04725	743 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SP7	Q8TDD2	431 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	CLDND1	Q9NY35	253 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	FZD1	Q9UP38	647 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	LRBA	P50851	2863 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		3.31	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	TM4SF5	O14894	197 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	MBTPS2	O43462	519 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SLC28A2	O43868	658 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	DIAPH2	O60879	1101 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	RARA	P10276	462 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	SNX17	Q15036	470 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	UBXN11	Q5T124	520 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		3.3	□□□□□ -1.88
HS1BP3-208	ENST00000631166	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		3.3	□□□□□ -1.88

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