RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 MIGA1Q8NAN2 632 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 DUOX1Q9NRD9 1551 aa15.4■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 CAMTA2O94983 1202 aa15.39■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PRR29P0C7W0 189 aa15.39■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 KCNH3Q9ULD8 1083 aa15.39■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.39■□□□□ 0.06
C9orf170-201ENST00000623052 MYH2Q9UKX2 1941 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 NR5A1Q13285 461 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 OXER1Q8TDS5 423 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 AK7Q96M32 723 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 NTSR2O95665 410 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MYL5Q02045 173 aa15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 JMYQ8N9B5 988 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MED15Q96RN5 788 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 NRAPQ86VF7 1730 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TMX1Q9H3N1 280 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FANCLQ9NW38 375 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 KCNJ6P48051 423 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ITPK1Q13572 414 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM139Q8IV31 216 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC82Q8N4S0 544 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 KRT23Q9C075 422 aa15.38■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 RTL9Q8NET4 1388 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FAM205CA6NFA0 338 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TDO2P48775 406 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM29Q14134 588 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 RTN1Q16799 776 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SEC23AQ15436 765 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 USP49Q70CQ1 688 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SDR42E1Q8WUS8 393 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MPHOSPH8Q99549 860 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.37■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PTPREP23469 700 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CHRNDQ07001 517 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 WTAPQ15007 396 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 VSTM4Q8IW00 320 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CNNM3Q8NE01 707 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 L2HGDHQ9H9P8 463 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 EXOC5O00471 708 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 UBASH3AP57075 661 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PPARAQ07869 468 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CCDC93Q567U6 631 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF384Q8TF68 577 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 WNT7AO00755 349 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 EVX2Q03828 476 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ELF2Q15723 593 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF827Q17R98 1081 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF654Q8IZM8 581 aa15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF804BA4D1E1 1349 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SARSP49591 514 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 DMTNQ08495 405 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 NT5DC1Q5TFE4 455 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 KIF18AQ8NI77 898 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 A0A087X0B3 334 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TPM4P67936 248 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 SERTAD1Q9UHV2 236 aa15.35■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 GNAT2P19087 354 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FUT2Q10981 343 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 PKN1Q16512 942 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 TOMM22Q9NS69 142 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 DEXIO95424 95 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 ZNF18P17022 549 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 POSTNQ15063 836 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 FANCBQ8NB91 859 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 LAMB1P07942 1786 aa15.34■□□□□ 0.05
C9orf170-201ENST00000623052 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms