RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621029.4

SEMA3B-215, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-215ENST00000621029 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP35.25■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 GOLIM4O00461 696 aa35.24■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 GADL1Q6ZQY3 521 aa35.24■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 CERS3Q8IU89 383 aa35.24■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP35.24■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM75PA6NK02 468 aa35.23■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 USP5P45974 858 aa35.23■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP35.23■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP35.23■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 PALD1Q9ULE6 856 aa35.23■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa35.23■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP35.22■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP35.21■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 HLA-DOAP06340 250 aa35.21■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 MOGSQ13724 837 aa35.21■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 KIF22Q14807 665 aa35.21■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa35.21■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa35.21■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP35.21■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 BOLA2Q9H3K6 86 aa35.2■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 CPA4Q9UI42 421 aa35.2■■■■□ 3.23
SEMA3B-215ENST00000621029 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 CAP2P40123 477 aa35.19■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP35.19■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 PTPN22Q9Y2R2 807 aa35.19■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 RGS19P49795 217 aa35.18■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP35.18■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa35.17■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 PDE6AP16499 860 aa35.17■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 GPAT2Q6NUI2 795 aa35.17■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP35.17■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 ATP5JP18859 108 aa35.16■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP35.16■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 PAG1Q9NWQ8 432 aa35.16■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 DOCK1Q14185 1865 aa35.16■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 CYP2C8P10632 490 aa35.15■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 CAP1Q01518 475 aa35.15■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 SPP2Q13103 211 aa35.15■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF532Q9HCE3 1301 aa35.14■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 USP17L5A8MUK1 530 aa35.14■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 C17orf99Q6UX52 265 aa35.14■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 ZNF280CQ8ND82 737 aa35.14■■■■□ 3.22
SEMA3B-215ENST00000621029 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa35.13■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 AS3MTQ9HBK9 375 aa35.13■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 TBC1D2Q9BYX2 928 aa35.12■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 DCTPP1Q9H773 170 aa35.12■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 HAUS7Q99871 368 aa35.11■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP35.11■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 DNAJC18Q9H819 358 aa35.11■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 GDF11O95390 407 aa35.1■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 ASNSP08243 561 aa35.1■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 TTC6Q86TZ1 520 aa35.1■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa35.09■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa35.09■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 HMGCS2P54868 508 aa35.08■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 GPATCH3Q96I76 525 aa35.08■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 ADGRA2Q96PE1 1338 aa35.07■■■■□ 3.21
SEMA3B-215ENST00000621029 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 PSMC4P43686 418 aa35.07■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 ECHDC1Q9NTX5 307 aa35.07■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 SERPINB13Q9UIV8 391 aa35.07■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa35.07■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa35.07■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa35.06■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa35.06■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 TREML2Q5T2D2 321 aa35.06■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 FOCADQ5VW36 1801 aa35.05■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 GNRH1P01148 92 aa35.05■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 JAG1P78504 1218 aa35.05■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 PNMA3Q9UL41 463 aa35.05■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa35.05■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 ADD2P35612 726 aa35.04■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa35.04■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 LCORLQ8N3X6 602 aa35.04■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 CRBNQ96SW2 442 aa35.04■■■■□ 3.2
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SEMA3B-215ENST00000621029 GINM1Q9NU53 330 aa35.04■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 MCM9Q9NXL9 1143 aa35.04■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP35.03■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 MTMR2Q13614 643 aa35.03■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 SLFNL1Q499Z3 407 aa35.03■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 TRIM47Q96LD4 638 aa35.03■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 WDR18Q9BV38 432 aa35.03■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 EHD4Q9H223 541 aa35.03■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 TMOD4Q9NZQ9 345 aa35.03■■■■□ 3.2
SEMA3B-215ENST00000621029 SIPA1L1O43166 1804 aa35.03■■■■□ 3.2
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