RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589627.1

VASP-208, Transcript of vasodilator stimulated phosphoprotein, human

TSL 3

Gene VASP, Length 696 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VASP-208	ENST00000589627	CPA4	Q9UI42	421 aa		28.99	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	28.98	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	DDX19B	Q9UMR2	479 aa		28.98	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	CTGF	P29279	349 aa		28.97	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	ZNF333	Q96JL9	665 aa		28.97	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		28.97	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	28.97	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		28.97	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	FLT1	P17948	1338 aa		28.96	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	POTEF	A5A3E0	1075 aa		28.96	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	BCR	P11274	1271 aa		28.96	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		28.96	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	28.96	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
VASP-208	ENST00000589627	PRMT2	P55345	433 aa		28.95	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	28.95	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	28.95	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	AACS	Q86V21	672 aa		28.95	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	COG6	Q9Y2V7	657 aa		28.95	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	CYP2C8	P10632	490 aa		28.94	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		28.94	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		28.94	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		28.94	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		28.94	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		28.94	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	TRIM75P	A6NK02	468 aa		28.93	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	CAP2	P40123	477 aa		28.93	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		28.93	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		28.93	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	TRIM47	Q96LD4	638 aa		28.93	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		28.93	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		28.92	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		28.92	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		28.92	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		28.92	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	CYP7A1	P22680	504 aa		28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	PSMC4	P43686	418 aa		28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	NBPF11	Q86T75	865 aa		28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	DNAJC18	Q9H819	358 aa		28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		28.91	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	HMMR	O75330	724 aa		28.9	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	IDH1	O75874	414 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	28.9	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		28.9	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	SRRD	Q9UH36	339 aa		28.9	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	MYH7	P12883	1935 aa		28.9	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	OSBP	P22059	807 aa		28.89	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	CERS3	Q8IU89	383 aa		28.89	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	28.89	■■■□□ 2.22
VASP-208	ENST00000589627	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		28.88	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		28.88	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	SPP2	Q13103	211 aa		28.87	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	TREML2	Q5T2D2	321 aa		28.87	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	28.87	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	28.87	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	28.87	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	PALD1	Q9ULE6	856 aa		28.87	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	USP17L5	A8MUK1	530 aa		28.86	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	HOXD10	P28358	340 aa		28.86	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	MAP3K12	Q12852	859 aa		28.86	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		28.86	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	28.86	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		28.86	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	SH3TC2	Q8TF17	1288 aa		28.86	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	28.85	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		28.85	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	MYPN	Q86TC9	1320 aa		28.85	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	RAB11FIP3	O75154	756 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	ASNS	P08243	561 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	FCGRT	P55899	365 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	JAG1	P78504	1218 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	PDE3A	Q14432	1141 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	WDR18	Q9BV38	432 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	GINM1	Q9NU53	330 aa		28.84	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	HMGCS2	P54868	508 aa		28.83	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		28.83	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	28.83	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	28.83	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	PNMA3	Q9UL41	463 aa		28.83	■■■□□ 2.21
VASP-208	ENST00000589627	HLA-DOA	P06340	250 aa		28.82	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	28.82	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	APBB1	O00213	710 aa		28.81	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	PRKCZ	Q05513	592 aa		28.81	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	MYH8	P13535	1937 aa		28.81	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	28.8	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		28.8	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	28.8	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	RAET1E	Q8TD07	263 aa		28.8	■■■□□ 2.2
VASP-208	ENST00000589627	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		28.8	■■■□□ 2.2

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