RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576346.5

NSF-208, Transcript of N-ethylmaleimide sensitive factor, vesicle fusing ATPase, human

TSL 4

Gene NSF, Length 710 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NSF-208	ENST00000576346	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	KIF2C	Q99661	725 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GPAM	Q9HCL2	828 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HCN4	Q9Y3Q4	1203 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ACE	P12821	1306 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	FAM83G	A6ND36	823 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ABL1	P00519	1130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TPM2	P07951	284 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	FAM184A	Q8NB25	1140 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MDFI	Q99750	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	RUBCNL	Q9H714	662 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SPON1	Q9HCB6	807 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ZDHHC3	Q9NYG2	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	TBX22	Q9Y458	520 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PRR36	Q9H6K5	1346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ABCC6	O95255	1503 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	AK9	Q5TCS8	1911 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	EML1	O00423	815 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	BMP4	P12644	408 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SDS	P20132	328 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	MX1	P20591	662 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ATP4A	P20648	1035 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PDE1A	P54750	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GRIN2C	Q14957	1233 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	RTN1	Q16799	776 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	EFHC2	Q5JST6	749 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	C16orf46	Q6P387	395 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NLRP8	Q86W28	1048 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	THEMIS	Q8N1K5	641 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GPATCH3	Q96I76	525 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	PHACTR1	Q9C0D0	580 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	NOP53	Q9NZM5	478 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	SLAIN2	Q9P270	581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	STAP2	Q9UGK3	403 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	KLF15	Q9UIH9	416 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.53	□□□□□ -1.68
NSF-208	ENST00000576346	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		4.53	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	PCNT	O95613	3336 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	AMPH	P49418	695 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	MAP7D2	Q96T17	732 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	MEIS3	Q99687	375 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	RRAGC	Q9HB90	399 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	SEPT3	Q9UH03	358 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	EGFL7	Q9UHF1	273 aa		4.52	□□□□□ -1.69
NSF-208	ENST00000576346	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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