RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559737.5

USP3-AS1-203, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP3-AS1, Length 1,434 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-203ENST00000559737 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 NBPF3Q9H094 633 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAF6LQ9Y6J9 622 aa22.22■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 MIGA2Q7L4E1 593 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 DNAJC18Q9H819 358 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.21■■□□□ 1.15
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC27A2O14975 620 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOMM70O94826 608 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 GABPAQ06546 454 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 EHD4Q9H223 541 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 INCENPQ9NQS7 918 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 FZD1Q9UP38 647 aa22.2■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 ROBO3Q96MS0 1386 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 HSPA4P34932 840 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.18■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 CDK8P49336 464 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 MAP3K10Q02779 954 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRKG1Q13976 671 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASEFQ8IZ41 740 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 MYH8P13535 1937 aa22.17■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 TBC1D12O60347 775 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 PRDM1O75626 825 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 HOOK2Q96ED9 719 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.16■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SHMT1P34896 483 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF20Q5VTR2 975 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 STOX1Q6ZVD7 989 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 KCNB2Q92953 911 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.15■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 NF2P35240 595 aa22.14■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 DCAF15Q66K64 600 aa22.14■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SWAP70Q9UH65 585 aa22.14■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.14■■□□□ 1.14
USP3-AS1-203ENST00000559737 E7EWF7 191 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 FGRP09769 529 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 MCCP23508 829 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 PDE4BQ07343 736 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 MOB2Q70IA6 237 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 NEDD4P46934 1319 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 PASKQ96RG2 1323 aa22.14■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 RASA1P20936 1047 aa22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 TOMM22Q9NS69 142 aa22.13■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 TSGA10IPQ3SY00 556 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 CST9Q5W186 159 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ORC4O43929 436 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 INPP5BP32019 993 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 KLRG1Q96E93 195 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 WRNIP1Q96S55 665 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.11■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 B4E1Z4 1266 aa22.1■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 GDF11O95390 407 aa22.1■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 JAG1P78504 1218 aa22.1■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 FSTL1Q12841 308 aa22.1■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.1■■□□□ 1.13
USP3-AS1-203ENST00000559737 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms