RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 M0R2C6 588 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 GPAA1O43292 621 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 AOC2O75106 756 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 GNAT2P19087 354 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 TTC6Q86TZ1 520 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ELP3Q9H9T3 547 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM196BA6NMK8 535 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 INPP5BP32019 993 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SPRYD7Q5W111 196 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 WNK4Q96J92 1243 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 EHD4Q9H223 541 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.66■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 PRKAB2O43741 272 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 LAMA4Q16363 1823 aa22.65■■□□□ 1.22
RABGGTA-208ENST00000558954 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 HIP1O00291 1037 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 ERO1BQ86YB8 467 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 OPTNQ96CV9 577 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.64■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.63■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0D9SFI3 127 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 SLURP2P0DP57 97 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 SDSP20132 328 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 OTUD5Q96G74 571 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM227BQ96M60 508 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 DNAJC18Q9H819 358 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 PICK1Q9NRD5 415 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.62■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.61■■□□□ 1.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.61■■□□□ 1.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.61■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 APPP05067 770 aa22.6■■□□□ 1.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.6■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.6■■□□□ 1.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 USP17L21D6R901 530 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 CAP2P40123 477 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 TDO2P48775 406 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.58■■□□□ 1.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 C12orf60Q5U649 245 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 CTR9Q6PD62 1173 aa22.58■■□□□ 1.21
RABGGTA-208ENST00000558954 WBP1LQ9NX94 342 aa22.58■■□□□ 1.21
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RABGGTA-208ENST00000558954 PTPRAP18433 802 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 SBK1Q52WX2 424 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 NAPBQ9H115 298 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 GINM1Q9NU53 330 aa22.57■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 SWAP70Q9UH65 585 aa22.57■■□□□ 1.2
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RABGGTA-208ENST00000558954 IRF6O14896 467 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 GTF2A2P52657 109 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 INHBEP58166 350 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH4Q9Y623 1939 aa22.56■■□□□ 1.2
RABGGTA-208ENST00000558954 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.55■■□□□ 1.2
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