RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 MRC1P22897 1456 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 KCPQ6ZWJ8 1503 aa5.74□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 LAMB2P55268 1798 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 DLEC1Q9Y238 1755 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 PARD3Q8TEW0 1356 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 PPP2R1AP30153 589 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 CCINQ13939 588 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 TXNRD1Q16881 649 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 FAM26DQ5JW98 314 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 MSL1Q68DK7 614 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00114Q6XXX2 140 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 PODXL2Q9NZ53 605 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 SPG7Q9UQ90 795 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 USTQ9Y2C2 406 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 KIF13BQ9NQT8 1826 aa5.73□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 GNB5O14775 395 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 OPLAHO14841 1288 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 GDF11O95390 407 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 PHKG2P15735 406 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 IL13P35225 146 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 RGL4Q8IZJ4 473 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM151AQ8N4L1 468 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 PNMA5Q96PV4 448 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 STK32BQ9NY57 414 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 TMOD3Q9NYL9 352 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 SEPT3Q9UH03 358 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 BCL9O00512 1426 aa5.72□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 TIAM2Q8IVF5 1701 aa5.71□□□□□ -1.49
TMOD3-204ENST00000558666 TAF1P21675 1872 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 KDRP35968 1356 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PIK3R2O00459 728 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ALBP02768 609 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ALAS2P22557 587 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 BRD2P25440 801 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SSFA2P28290 1259 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PRKAR2BP31323 418 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SCNN1AP37088 669 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf141Q5JVX7 400 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 CFAP53Q96M91 514 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TRAIPQ9BWF2 469 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 NAGPAQ9UK23 515 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 WWC3Q9ULE0 1092 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SLC6A14Q9UN76 642 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 USP20Q9Y2K6 914 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 STARD13Q9Y3M8 1113 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 KCNMB2Q9Y691 235 aa5.71□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K5Q99683 1374 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 CARNS1A5YM72 827 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MAP3K6O95382 1288 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 EGFRP00533 1210 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 COL8A1P27658 744 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC146Q8IYE0 955 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 IFNL2Q8IZJ0 200 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 HELQQ8TDG4 1101 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PIGBQ92521 554 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 DCAF5Q96JK2 942 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SUV39H2Q9H5I1 410 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ZFATQ9P243 1243 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 STIM2Q9P246 746 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ASAP1Q9ULH1 1129 aa5.7□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 M0R082 166 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 XYLBO75191 536 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 RARAP10276 462 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ZAP70P43403 619 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 CABP4P57796 275 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SLC39A6Q13433 755 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 DCTN1Q14203 1278 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 SLC15A2Q16348 729 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 AMIGO3Q86WK7 504 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00116Q8NCU8 138 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF417Q8TAU3 575 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 TRIM11Q96F44 468 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 LGR6Q9HBX8 967 aa5.69□□□□□ -1.5
TMOD3-204ENST00000558666 PRDM6Q9NQX0 595 aa5.69□□□□□ -1.5
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