RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556288.5

ATXN3-238, Transcript of ataxin 3, human

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 901 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-238	ENST00000556288	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	SBF2	Q86WG5	1849 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	EXOC5	O00471	708 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	CPB1	P15086	417 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	BAG6	P46379	1132 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	GPLD1	P80108	840 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	OR13H1	Q8NG92	308 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	IP6K1	Q92551	441 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	CNTN3	Q9P232	1028 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	DCTN4	Q9UJW0	460 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ATXN3-238	ENST00000556288	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS12	O14924	1447 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SLIT3	O75094	1523 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288		J3QW42	95 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	TNFRSF21	O75509	655 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	CES1	P23141	567 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SOX18	P35713	384 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SIK1	P57059	783 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	HYAL2	Q12891	473 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	DDB1	Q16531	1140 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	STARD13	Q9Y3M8	1113 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	CPD	O75976	1380 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	AATK	Q6ZMQ8	1374 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	USP31	Q70CQ4	1352 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	CCDC7	Q96M83	1385 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	USP54	Q70EL1	1684 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288		M0R082	166 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	PHACTR2	O75167	634 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	GHRH	P01286	108 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXC9	P31274	260 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SNRPN	P63162	240 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	PSAPL1	Q6NUJ1	521 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	PODN	Q7Z5L7	613 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	MICALL1	Q8N3F8	863 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF417	Q8TAU3	575 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NUDT8	Q8WV74	236 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	PMEPA1	Q969W9	287 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SPACA7	Q96KW9	195 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	ZNF587	Q96SQ5	575 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM129B	Q96TA1	746 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	CARD10	Q9BWT7	1032 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	CRB1	P82279	1406 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NFAT5	O94916	1531 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	TRIM37	O94972	964 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	ALB	P02768	609 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NEFL	P07196	543 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	FURIN	P09958	794 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	C8orf86	Q6ZUL3	223 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	TMC7	Q7Z402	723 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NIF3L1	Q9GZT8	377 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	RBSN	Q9H1K0	784 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	KANSL3	Q9P2N6	904 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NAGPA	Q9UK23	515 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	THRAP3	Q9Y2W1	955 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM208A	Q9UK61	1670 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	PEAK1	Q9H792	1746 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	CDK12	Q9NYV4	1490 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	EREG	O14944	169 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	LILRB5	O75023	590 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	APBA3	O96018	575 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	IL2RB	P14784	551 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	DGKG	P49619	791 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	PERM1	Q5SV97	790 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	C20orf204	Q6ZNR8	217 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	NBPF4	Q96M43	638 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ATXN3-238	ENST00000556288	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41

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