RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551594.1

CTDSP2-207, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 3

Gene CTDSP2, Length 900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-207ENST00000551594 CLMNQ96JQ2 1002 aa22.49■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 TTC6Q86TZ1 520 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 WRNIP1Q96S55 665 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 DNAJC18Q9H819 358 aa22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 TBC1D12O60347 775 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 INPP5BP32019 993 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 TDO2P48775 406 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 MAP3K9P80192 1104 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 C12orf60Q5U649 245 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 DYNLL2Q96FJ2 89 aa22.47■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.46■■□□□ 1.19
CTDSP2-207ENST00000551594 RASSF10A6NK89 507 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 NAPBQ9H115 298 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 EHD4Q9H223 541 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.45■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SGSM2O43147 1006 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 CDC45O75419 566 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 GRM1Q13255 1194 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 VGLL4Q14135 290 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SBK1Q52WX2 424 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 CEP350Q5VT06 3117 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 RGMBQ6NW40 437 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ELP3Q9H9T3 547 aa22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 RAD50Q92878 1312 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 FGAP02671 866 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 GABPAQ06546 454 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.43■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ALX1Q15699 326 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 CSADQ9Y600 493 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 LAMB1P07942 1786 aa22.42■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 SHMT1P34896 483 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 VEGFBP49765 207 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 JAG1P78504 1218 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 PTH1RQ03431 593 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 CAPNS2Q96L46 248 aa22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 GDF11O95390 407 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 CDK8P49336 464 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 PPARAQ07869 468 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 RASAL3Q86YV0 1011 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.4■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 MYH8P13535 1937 aa22.39■■□□□ 1.18
CTDSP2-207ENST00000551594 UNCXA6NJT0 531 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 CAP2P40123 477 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 DOCK1Q14185 1865 aa22.39■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 AOC2O75106 756 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 SLC10A3P09131 477 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 GJA5P36382 358 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 HAND2P61296 217 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 ZIC5Q96T25 663 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 INCENPQ9NQS7 918 aa22.38■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 CASC1Q6TDU7 716 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 CCDC102AQ96A19 550 aa22.37■■□□□ 1.17
CTDSP2-207ENST00000551594 OPTNQ96CV9 577 aa22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms