RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538923.1

MRE11-208, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, human

TSL 5

Gene MRE11, Length 558 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRE11-208	ENST00000538923	SUCLG2	Q96I99	432 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	RIPOR2	Q9Y4F9	1068 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.19	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	UTY	O14607	1347 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	ANP32C	O43423	234 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	CCL15	Q16663	113 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	TEKT1	Q969V4	418 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	HOOK2	Q96ED9	719 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		11.18	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	KDM4A	O75164	1064 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	FUT2	Q10981	343 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	METTL24	Q5JXM2	366 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	NBPF11	Q86T75	865 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	KAZALD1	Q96I82	304 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	TMOD2	Q9NZR1	351 aa		11.17	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	MAST3	O60307	1309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	PDE8B	O95263	885 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	CETP	P11597	493 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	COPS2	P61201	443 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	FAM83A	Q86UY5	434 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF333	Q96JL9	665 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	MRI	Q9BWK5	157 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	SUGT1	Q9Y2Z0	365 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923		A0A1B0GUL6	1792 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	LAMB1	P07942	1786 aa		11.16	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	KIF16B	Q96L93	1317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	CACNB3	P54284	484 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	KIF22	Q14807	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	GRIK5	Q16478	980 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	LRRC24	Q50LG9	513 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	HABP4	Q5JVS0	413 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	ERO1B	Q86YB8	467 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	WRNIP1	Q96S55	665 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.15	□□□□□ -0.62
MRE11-208	ENST00000538923	TLR2	O60603	784 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	GNRH1	P01148	92 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	USP46	P62068	366 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	CAP1	Q01518	475 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	SNAPC2	Q13487	334 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	DCAF15	Q66K64	600 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	BLOC1S3	Q6QNY0	202 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	ANKRD44	Q8N8A2	993 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	MTR	Q99707	1265 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		11.14	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	PTPRC	P08575	1304 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	BTBD19	C9JJ37	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	PPIL2	Q13356	520 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	HHIPL2	Q6UWX4	724 aa		11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	CENPF	P49454	3210 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	PRMT2	P55345	433 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	PPAT	Q06203	517 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	SPIRE2	Q8WWL2	714 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	IL21	Q9HBE4	155 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		11.12	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	SLC5A1	P13866	664 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	FGFR2	P21802	821 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	FAM151A	Q8WW52	585 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.11	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	ZNF521	Q96K83	1311 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	CACNA1F	O60840	1977 aa		11.1	□□□□□ -0.63
MRE11-208	ENST00000538923	OTOF	Q9HC10	1997 aa		11.1	□□□□□ -0.63

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