RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 PDE4AP27815 886 aa22.6■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 MECOMQ03112 1051 aa22.6■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 KIF22Q14807 665 aa22.6■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.6■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 SLURP2P0DP57 97 aa22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 MX1P20591 662 aa22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 PICALMQ13492 652 aa22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 KCNH4Q9UQ05 1017 aa22.59■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 CTGFP29279 349 aa22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 BTDP43251 543 aa22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 PDE1AP54750 535 aa22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 MOGSQ13724 837 aa22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD23Q86SG2 305 aa22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
PUF60-218ENST00000531995 GOLIM4O00461 696 aa22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 LRP2BPQ9P2M1 347 aa22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.57■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 NBPF11Q86T75 865 aa22.56■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 GPATCH3Q96I76 525 aa22.56■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 IDI2Q9BXS1 227 aa22.56■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.56■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 RAI14Q9P0K7 980 aa22.56■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 ENTPD3O75355 529 aa22.55■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 C17orf99Q6UX52 265 aa22.55■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.55■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 TRIM47Q96LD4 638 aa22.55■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 CYP2C8P10632 490 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 PSMC4P43686 418 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 ADGRA1Q86SQ6 560 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 PICK1Q9NRD5 415 aa22.54■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 SIPA1L1O43166 1804 aa22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 IGSF3O75054 1194 aa22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 SLF2Q8IX21 1173 aa22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 ZHX2Q9Y6X8 837 aa22.53■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 FAM196BA6NMK8 535 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 CHGBP05060 677 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 PTPRAP18433 802 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 OSBPP22059 807 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 GPAT2Q6NUI2 795 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 MYPNQ86TC9 1320 aa22.52■■□□□ 1.2
PUF60-218ENST00000531995 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.51■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 ERC2O15083 957 aa22.51■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 GNRH1P01148 92 aa22.51■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.51■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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PUF60-218ENST00000531995 FOCADQ5VW36 1801 aa22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 RHBDL3P58872 404 aa22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 GSTO1P78417 241 aa22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 MTFR1Q15390 333 aa22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 SKAP1Q86WV1 359 aa22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 CEP290O15078 2479 aa22.5■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 TRIM75PA6NK02 468 aa22.49■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 CXCL11O14625 94 aa22.49■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 LDHCP07864 332 aa22.49■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 PDE6AP16499 860 aa22.49■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 CYP7A1P22680 504 aa22.49■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K12Q12852 859 aa22.49■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 RAET1EQ8TD07 263 aa22.49■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 BCRP11274 1271 aa22.48■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 PRMT2P55345 433 aa22.48■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 PPP4CP60510 307 aa22.48■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 PRKCZQ05513 592 aa22.48■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.48■■□□□ 1.19
PUF60-218ENST00000531995 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.48■■□□□ 1.19
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